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Enregistrement W4396779989 · doi:10.1093/ehjci/jeae123

Evaluation of deep learning estimation of whole heart anatomy from automated cardiovascular magnetic resonance short- and long-axis analyses in UK Biobank

2024· article· en· W4396779989 sur OpenAlexaff
Marica Muffoletto, Hao Xu, Richard Burns, Avan Suinesiaputra, Anastasia Nasopoulou, Karl Kunze, Radhouène Neji, Steffen E. Petersen, Steven Niederer, Daniel Rueckert, Alistair A. Young

Notice bibliographique

RevueEuropean Heart Journal - Cardiovascular Imaging · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac Imaging and Diagnostics
Établissements canadiensInnovation Cluster (Canada)
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood InstituteEngineering and Physical Sciences Research CouncilSiemens HealthineersCentre For Medical Engineering, King’s College LondonWellcome TrustWellcome
Mots-clésBiobankMagnetic resonance imagingCardiac magnetic resonanceEstimationVolume (thermodynamics)Cardiac magnetic resonance imagingDeep learningCardiovascular healthMedicineArtificial neural networkArtificial intelligenceComputer scienceDiseaseRadiologyBioinformaticsInternal medicineEngineeringPhysicsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIMS: Standard methods of heart chamber volume estimation in cardiovascular magnetic resonance (CMR) typically utilize simple geometric formulae based on a limited number of slices. We aimed to evaluate whether an automated deep learning neural network prediction of 3D anatomy of all four chambers would show stronger associations with cardiovascular risk factors and disease than standard volume estimation methods in the UK Biobank. METHODS AND RESULTS: A deep learning network was adapted to predict 3D segmentations of left and right ventricles (LV, RV) and atria (LA, RA) at ∼1 mm isotropic resolution from CMR short- and long-axis 2D segmentations obtained from a fully automated machine learning pipeline in 4723 individuals with cardiovascular disease (CVD) and 5733 without in the UK Biobank. Relationships between volumes at end-diastole (ED) and end-systole (ES) and risk/disease factors were quantified using univariate, multivariate, and logistic regression analyses. Strength of association between deep learning volumes and standard volumes was compared using the area under the receiving operator characteristic curve (AUC). Univariate and multivariate associations between deep learning volumes and most risk and disease factors were stronger than for standard volumes (higher R2 and more significant P-values), particularly for sex, age, and body mass index. AUCs for all logistic regressions were higher for deep learning volumes than standard volumes (P < 0.001 for all four chambers at ED and ES). CONCLUSION: Neural network reconstructions of whole heart volumes had significantly stronger associations with CVD and risk factors than standard volume estimation methods in an automatic processing pipeline.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,008
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,609
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0080,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,338
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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