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Enregistrement W4396781237 · doi:10.1038/s43856-024-00502-1

A comprehensive AI model development framework for consistent Gleason grading

2024· article· en· W4396781237 sur OpenAlexaff
Xinmi Huo, Kok Haur Ong, Kah Weng Lau, Laurent Golé, David M. Young, Char Loo Tan, Xiaohui Zhu, Chongchong Zhang, Yonghui Zhang, Longjie Li, Han Hao, Haoda Lu, Jing Zhang, Jun Hou, Huanfen Zhao, Hualei Gan, Lijuan Yin, Xingxing Wang, Xiaoyue Chen, Hong Lv, Haotian Cao, Xiaozhen Yu, Yabin Shi, Ziling Huang, Gabriel Pik Liang Marini, Jun Xu, Bingxian Liu, Bingxian Chen, Qiang Wang, Kun Gui, Wenzhao Shi, Yingying Sun, Wanyuan Chen, Dalong Cao, Stephan Sanders, Hwee Kuan Lee, Susan Swee‐Shan Hue, Weimiao Yu, Soo‐Yong Tan

Notice bibliographique

RevueCommunications Medicine · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueAI in cancer detection
Établissements canadiensArtificial Intelligence in Medicine (Canada)
Organismes subventionnairesAgency for Science, Technology and Research
Mots-clésComputer scienceWorkflowArtificial intelligenceScannerGrading (engineering)Digital pathologyScalabilityImage qualityPattern recognition (psychology)Machine learningComputer visionImage (mathematics)Database

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Artificial Intelligence(AI)-based solutions for Gleason grading hold promise for pathologists, while image quality inconsistency, continuous data integration needs, and limited generalizability hinder their adoption and scalability. METHODS: We present a comprehensive digital pathology workflow for AI-assisted Gleason grading. It incorporates A!MagQC (image quality control), A!HistoClouds (cloud-based annotation), Pathologist-AI Interaction (PAI) for continuous model improvement, Trained on Akoya-scanned images only, the model utilizes color augmentation and image appearance migration to address scanner variations. We evaluate it on Whole Slide Images (WSI) from another five scanners and conduct validations with pathologists to assess AI efficacy and PAI. RESULTS: Our model achieves an average F1 score of 0.80 on annotations and 0.71 Quadratic Weighted Kappa on WSIs for Akoya-scanned images. Applying our generalization solution increases the average F1 score for Gleason pattern detection from 0.73 to 0.88 on images from other scanners. The model accelerates Gleason scoring time by 43% while maintaining accuracy. Additionally, PAI improve annotation efficiency by 2.5 times and led to further improvements in model performance. CONCLUSIONS: This pipeline represents a notable advancement in AI-assisted Gleason grading for improved consistency, accuracy, and efficiency. Unlike previous methods limited by scanner specificity, our model achieves outstanding performance across diverse scanners. This improvement paves the way for its seamless integration into clinical workflows.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,023
Score d'incertitude au seuil0,047

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0010,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,146
Tête enseignante GPT0,396
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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