Hidden diversity in eastern North America: The genus <i>Ligidium</i> (Oniscidea, Ligiidae) in the southern Appalachian Mountains
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The terrestrial isopod genus Ligidium includes 58 species from Europe, Asia, and North America. In Eastern North America four species are recognized: L. floridanum and L. mucronatum, known just from their type localities in Florida and Louisiana respectively, L. blueridgensis, endemic to the southern Appalachians, and L. elrodii, widespread from Georgia to Ontario. The genus shows a marked morphological conservatism, and species are differentiated mostly by small morphological differences; it is not always easy to determine if such variability represents inter‐ or intraspecific variation. Here, we explore the diversity of Ligidium from the southern Appalachian Mountains, exploring the congruence of morphologically defined groups with multilocus phylogenetic reconstructions and molecular species delimitation methods. We have studied a total of 130 specimens from 37 localities, mostly from the southern Appalachians, and analysed mtDNA (Cox1) and nuclear (28S, NaK) sequences. Morphologically, we recognized eight morphotypes, most of them assignable to current concepts of L. elrodii and L. blueridgensis. Phylogenetic analyses supported the evolutionary independence of all morphotypes, and suggest the existence of 8–9 species, including limited cryptic diversity. Single‐locus delimitation analyses based on mtDNA data suggest the existence of a much higher number of species than the multilocus analyses. The estimated age of the ancestors of sampled lineages indicates a long presence of the genus in eastern North America and old speciation events through the Miocene. Our results indicate a higher diversity than previously thought among the Ligidium populations present in the southern Appalachian Mountains, with several species to be described.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».