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Enregistrement W4396811877 · doi:10.1101/2024.05.09.593293

Contraction-induced endocardial <i>id2b</i> plays a dual role in regulating myocardial contractility and valve formation

2024· preprint· en· W4396811877 sur OpenAlexaff
Shuo Chen, Jinxiu Liang, Jie Yin, Weijia Zhang, Peijun Jiang, Wenyuan Wang, Xiaoying Chen, Yuanhong Zhou, Peng Xia, Fan Yang, Ying Gu, Ruilin Zhang, Peidong Han

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCongenital heart defects research
Établissements canadiensInstitute of Genetics
Organismes subventionnairesNational Key Research and Development Program of ChinaNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésContractilityContraction (grammar)CardiologyInternal medicineDual (grammatical number)ChemistryMedicinePhilosophy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Biomechanical cues play an essential role in sculpting organ formation. Comprehending how cardiac cells perceive and respond to biomechanical forces is a biological process with significant medical implications that remains poorly understood. Here we show that biomechanical forces activate endocardial id2b (inhibitor of DNA binding 2b) expression, thereby promoting cardiac contractility and valve formation. Taking advantage of the unique strengths of zebrafish, particularly the viability of embryos lacking heartbeats, we systematically compared the transcriptomes of hearts with impaired contractility to those of control hearts. This comparison identified id2b as a gene sensitive to blood flow. By generating a knockin reporter line, our results unveiled the presence of id2b in the endocardium, and its expression is sensitive to both pharmacological and genetic perturbations of contraction. Furthermore, id2b loss-of-function resulted in progressive heart malformation and early lethality. Combining RNA-seq analysis, electrophysiology, calcium imaging, and echocardiography, we discovered profound impairment in atrioventricular (AV) valve formation and defective excitation-contraction coupling in id2b mutants. Mechanistically, deletion of id2b reduced AV endocardial cell proliferation and led to a progressive increase in retrograde blood flow. In the myocardium, id2b directly interacted with the bHLH component tcf3b (transcription factor 3b) to restrict its activity. Inactivating id2b unleashed its inhibition on tcf3b , resulted in enhanced repressor activity of tcf3b , which subsequently suppressed the expression of nrg1 (neuregulin 1), an essential mitogen for heart development. Overall, our findings identify id2b as an endocardial cell-specific, biomechanical signaling-sensitive gene, which mediates intercellular communications between endocardium and myocardium to sculpt heart morphogenesis and function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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