Structural biology of glucose-6-phosphate dehydrogenase and small-molecule activators
Notice bibliographique
Résumé
Glucose-6-phosphate dehydrogenase (G6PD) is a rate-limiting enzyme in the pentose phosphate pathway.It's essential for the production of NADPH and glutathione, and the reduction of reactive oxygen species.G6PD exists as inactive monomers and active dimers and tetramers, with its structure and activity sensitive to the presence of its co-factors NADP+ and glucose-6phosphate.G6PD deficiency is one of the most common enzymatic disorders, with over 150 single mutations known to affect enzyme activity.G6PD activity also declines with age and is associated with the accumulation of oxidative DNA damage [1].By contrast, increased G6PD activity has been shown to extend lifespan and healthspan in animal models [2].Overcoming G6PD decline and deficiency with the use of activators may help prevent diseases of ageing and treat hereditary G6PD deficiency.Indeed, novel small molecule activators of G6PD increase the lifespan of worms.Here, we explore the mechanisms by which small molecules activate G6PD using X-ray crystallography, analytical size exclusion chromatography and HDX-MS.It was hypothesised that these molecules stabilise G6PD in its more active tetrameric state.However, we've found that these small molecule activators do not alter the oligomeric state of G6PD in solution.Instead, X-ray crystallography reveals a paradox where the soaking of a small molecule activator into the crystals results into the loss of density for structural NADP+, which is usually associated with reduced G6PD activity [3,4].
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».