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Enregistrement W4396856616 · doi:10.1099/mgen.0.001251

Inferring diet, disease and antibiotic resistance from ancient human oral microbiomes

2024· article· en· W4396856616 sur OpenAlexaff
Gwyn Dahlquist-Axe, Francesca J. Standeven, Camilla Speller, Andrew Tedder, Conor J. Meehan

Notice bibliographique

RevueMicrobial Genomics · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineDentistry
ThématiqueOral microbiology and periodontitis research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesUniversity of Bradford
Mots-clésMicrobiomeAntibiotic resistanceOral MicrobiomeDiseaseResistance (ecology)AntibioticsBiologyHost (biology)Human microbiomeMetagenomicsEcologyMedicineMicrobiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The interaction between a host and its microbiome is an area of intense study. For the human host, it is known that the various body-site-associated microbiomes impact heavily on health and disease states. For instance, the oral microbiome is a source of various pathogens and potential antibiotic resistance gene pools. The effect of historical changes to the human host and environment to the associated microbiome, however, has been less well explored. In this review, we characterize several historical and prehistoric events which are considered to have impacted the oral environment and therefore the bacterial communities residing within it. The link between evolutionary changes to the oral microbiota and the significant societal and behavioural changes occurring during the pre-Neolithic, Agricultural Revolution, Industrial Revolution and Antibiotic Era is outlined. While previous studies suggest the functional profile of these communities may have shifted over the centuries, there is currently a gap in knowledge that needs to be filled. Biomolecular archaeological evidence of innate antimicrobial resistance within the oral microbiome shows an increase in the abundance of antimicrobial resistance genes since the advent and widespread use of antibiotics in the modern era. Nevertheless, a lack of research into the prevalence and evolution of antimicrobial resistance within the oral microbiome throughout history hinders our ability to combat antimicrobial resistance in the modern era.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,859
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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