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Enregistrement W4396890767 · doi:10.1101/2024.05.10.24306768

Biallelic variants in <i>ARHGAP19</i> cause a motor-predominant neuropathy with asymmetry and conduction slowing

2024· preprint· en· W4396890767 sur OpenAlexaff
Natalia Dominik, Stéphanie Efthymiou, Christopher J. Record, Xinyu Miao, Reneé C. Lin, J. Parmar, Annarita Scardamaglia, Reza Maroofian, Gabriel Aughey, Abigail D. Wilson, Simon A. Lowe, Riccardo Curró, Ricardo Parolin Schnekenberg, Shahryar Alavi, Leif Leclaire, Yi He, Kristina Zhelchenska, Yohanns Bellaı̈che, Isabelle Gaugué, Mariola Skorupinska, Liedewei Van de Vondel, Sahar Da’as, Valentina Turchetti, Serdal Güngör, Ehsan Ghayoor Karimiani, Camila Armirola-Ricaurte, Haluk Topaloğlu, Albena Jordanova, Mashaya Zaman, Selina Banu, Wilson Marques, Pedro José Tomaselli, Büşra Aynekin, Ali Cansu, Hüseyin Per, Ayten Güleç, Javeria Raza Alvi, Tipu Sultan, Arif Khan, Giovanni Zifarelli, Shahnaz Ibrahim, Grazia M.S. Mancini, M. Mahdi Motazacker, Esther Brusse, Vincenzo Lupo, Teresa Sevilla, A. Nazlı Başak, Şeyma Tekgül, Robin Palvadeau, Jonathan Baets, Yeşim Parman, Arman Çakar, Rita Horváth, Tobias B. Haack, J. Stahl, Kathrin Grundmann‐Hauser, Joohyun Park, Stephan Züchner, Nigel G. Laing, Lindsay Wilson, Alexander M. Rossor, James M. Polke, Fernanda Barbosa Figueiredo, André Luiz Santos Pessoa, Fernando Kok, Antônio Rodrigues Coimbra Neto, Marcondes C. França, Yalda Jamshidi, Gianina Ravenscroft, Sherifa A. Hamed, Wendy K. Chung, Daniel P. S. Osborn, Michael G. Hanna, Andrea Cortese, Mary M. Reilly, James E.C. Jepson, Nathalie Lamarche‐Vane, Henry Houlden

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueHereditary Neurological Disorders
Établissements canadiensMcGill University Health CentreMcGill University
Organismes subventionnairesMedical Research Council
Mots-clésZebrafishBiologyRHOALoss functionGene knockdownPhenotypeGeneticsDrosophila melanogasterNeuroscienceGTPaseGeneSignal transduction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Charcot-Marie-Tooth Disease is a clinically and genetically heterogeneous group of hereditary neuropathies, with over 100 causative genes identified to date. Despite progress in genetic sequencing, around a quarter of patients remain unsolved. Through international collaborations, we identified 16 recessive variants in Rho GTPase activating protein 19 ( ARHGAP19 ) causing motor-predominant neuropathy with conduction slowing in 25 individuals from 20 unrelated multi-ancestry families. ARHGAP19 is a GTPase-activating protein with activity towards RhoA. In vitro biochemical assays revealed that variants located within the GAP domain cause loss of GAP activity. iPSc-derived motor neurons exhibited 50% knockdown of ARHGAP19 protein. In vivo genetic perturbations of the Drosophila melanogaster ARHGAP19 ortholog RhoGAP54D reduced self-driven locomotor activity and startle responses to visual stimuli. Zebrafish loss-of-function models similarly exhibited movement deficits, coupled with increased motor neuron axonal branching but shorter caudal primary motor neurons. Together, these findings establish ARHGAP19 as a novel cause of early-onset neuropathy through a loss-of-function mechanism.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,760
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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