Wagner diagram for modeling O<sub>2</sub> pathway—calculation and graphical display by the Helsinki O<sub>2</sub> Pathway Tool
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Objective. Maximal O2 uptake ( V ˙ O 2 max ) reflects the individual’s maximal rate of O2 transport and utilization through the integrated whole-body pathway composed of the lungs, heart, blood, circulation, and metabolically active tissues. As such, V ˙ O 2 max is strongly associated with physical capacity as well as overall health and thus acts as one predictor of physical performance and as a vital sign in determination of status and progress of numerous clinical conditions. Quantifying the contribution of single parts of the multistep O2 pathway to V ˙ O 2 max provides mechanistic insights into exercise (in)tolerance and into therapy-, training-, or disuse-induced adaptations at individual or group levels. We developed a desktop application (Helsinki O2 Pathway Tool—HO2PT) to model numerical and graphical display of the O2 pathway based on the ‘Wagner diagram’ originally formulated by Peter D. Wagner and his colleagues. Approach. The HO2PT was developed and programmed in Python to integrate the Fick principle and Fick’s law of diffusion into a computational system to import, calculate, graphically display, and export variables of the Wagner diagram. Main results. The HO2PT models O2 pathway both numerically and graphically according to the Wagner diagram and pertains to conditions under which the mitochondrial oxidative capacity of metabolically active tissues exceeds the capacity of the O2 transport system to deliver O2 to the mitochondria. The tool is based on the Python open source code and libraries and freely and publicly available online for Windows, macOS, and Linux operating systems. Significance. The HO2PT offers a novel functional and demonstrative platform for those interested in examining V ˙ O 2 max and its determinants by using the Wagner diagram. It will improve access to and usability of Wagner’s and his colleagues’ integrated physiological model and thereby benefit users across the wide spectrum of contexts such as scientific research, education, exercise testing, sports coaching, and clinical medicine.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,075 | 0,015 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».