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Enregistrement W4396936541 · doi:10.1101/2024.05.11.593573

Climate resilience conserved in global germplasm repositories: Picking the most promising parents for agile plant breeding

2024· preprint· en· W4396936541 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant and soil sciences
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGermplasmResilience (materials science)Agile software developmentClimate changeEnvironmental resource managementBiotechnologyBiologyComputer scienceEnvironmental scienceEcologyAgronomySoftware engineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Crop diversity is an essential resource for national and international breeding programs aimed at preparing global agriculture for a changing climate to ensure global food security. To do this there are related risks that need to be evaluated (1) does the genetic diversity needed for climate adaptation exist somewhere? And (2) is such genetic diversity accessible? To evaluate these risks, we consider the test case of publicly available genotyped and georeferenced sorghum landraces (n = 1,937) to ask if diversity is sufficient to support breeding for climate change adaptation. Answering these questions allows for characterization of the best potential parents and the geographies that harbor the most potentially promising genetypes for crop improvement. We subset this data into national, regional, and global geographic regions, and complete/mini core collections to understand the potential for climate adaptation in regional germplasm. Study accessions were given a future climate resilience score based on future climatic projections and a genomic adaptive capacity score using genomic estimated adaptive values (GEAVs) generated from environmental genomic selection - EGS) to ask whether this accessible diversity stored in germplasm repositories is potentially sufficient to meet forecasted changes in growing environments under climate change. We find that genomic resilience capacity is highly variable among countries and regions. High geographical variability was also found for climate resilience. To equitably adapt agriculture to future climate conditions, increased accessibility to plant genetic resources is essential.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,747
Score d'incertitude au seuil0,936

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle