MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4396953633 · doi:10.1161/circ.149.suppl_1.p408

Abstract P408: Plasma Metabolomic Profile of Dyslipidemia in Childhood: Genetics of Glucose Regulation in Gestation and Growth (Gen3G) Study

2024· article· en· W4396953633 sur OpenAlexaff
Zhila Semnani‐Azad, Patrice Perron, Luigi Bouchard, Marie‐France Hivert

Notice bibliographique

RevueCirculation · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNutrition, Genetics, and Disease
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineDyslipidemiaMetabolomicsGestationInternal medicineEndocrinologyPhysiologyGeneticsPregnancyBioinformaticsDiabetes mellitusBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective: Dyslipidemia is a major risk factor for atherosclerosis development. Evidence suggests atherosclerotic plaque accumulation can begin in childhood and lead to adverse cardiovascular events into adulthood. The use of metabolomics to identify metabolites specific to dyslipidemia may provide insights into the pathogenesis of cardiovascular-related outcomes. Thus, our aim was to identify metabolite networks associated with dyslipidemia in childhood. Methods: We used cross-sectional data from 326 children (median age of 5.2 years) from Gen3G, a prospective pre-birth cohort. We evaluated 1,038 plasma metabolites (798 annotated and 240 unannotated). Lipid measures included total cholesterol, non-HDL, LDL, triglyceride, and HDL. Using the AHA and the American Academy of Pediatrics guidelines, we identified normal and borderline/high classifications for each lipid. We applied weighted-correlation network analysis to find highly correlated metabolite networks. Spearman’s partial correlations were applied to assess the associations of lipids with metabolite networks, adjusting for age and sex, with false discovery rate correction. Results: We identified a green module of 120 metabolites, mainly comprised of lipids, that showed positive correlations with total cholesterol, non-HDL, and LDL classified as borderline/high vs normal (ρ adjusted = 0.28 to 0.40) and as continuous measures (ρ adjusted = 0.32 to 0.63), while HDL (borderline/high vs normal) was inversely associated ( Figure ). In this module, sphingomyelin (d18:2/16:0, d18:1/16:1)* and sphingomyelin (d18:2/23:0, d18:1/23:1, d17:1/24:1)* appeared to be driving the associations. Also, the blue and yellow modules showed inverse correlations (mainly driven by 10-nonadecenoate (19:1n9) and 3-hydroxyhexanoate, respectively), while the brown module showed positive correlations with triglyceride (driven by 1-palmitoyl-GPC (16:0)). Conclusions: A unique network of metabolites was associated with dyslipidemia in childhood.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,017

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCirculationMême sujetNutrition, Genetics, and DiseaseTravaux en français237 207