Modelling the dispersion of infectious salmon anemia virus from Atlantic salmon farms in the Quoddy Region of New Brunswick, Canada and Maine, USA
Notice bibliographique
Résumé
Pathogen dispersal from infected aquaculture sites into the surrounding ocean poses risks of infection to wild and farmed species, but is difficult to predict. This study aimed to build a framework using an ocean circulation and a particle tracking model in conjunction with a dynamic infection model and a virus inactivation model to simulate the dispersal of the infectious salmon anemia virus (ISAV) from Atlantic salmon farms. Simulated particles were released from hypothetically infected farms and advected by modelled currents. Inactivation of viral cohorts by ambient ultraviolet radiation and natural microbial communities was simulated during advection. Simulations showed that ISAV concentration varied spatiotemporally with the progression of the outbreak, current speed and direction, tidal elevation amplitude, and environmental decay. Connectivity among aquaculture sites varied in relation to seaway distances, though simulations showed that connectivity can also be asymmetrical between farm sites. Sensitivity analyses showed that the dispersal of ISAV was moderately sensitive to uncertainty associated with the viral decay model, highlighting the importance of obtaining accurate estimates of inactivation rates of ISAV. This framework provides an approach to simulate waterborne viral transmission that considers the biology and epidemic features of significance for pathogens and the dynamic conditions of the ocean.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».