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Enregistrement W4396975431 · doi:10.5858/arpa.2023-0236-oa

Genetic Landscape and Its Prognostic Impact in Children With Langerhans Cell Histiocytosis

2024· article· en· W4396975431 sur OpenAlexaff
Chanjuan Wang, Lei Cui, Shuangshuang Li, Honghao Ma, Dong Wang, Hongyun Lian, Yunze Zhao, Weijing Li, Qing Zhang, Xiaoxi Zhao, Ying Yang, Xiao‐Tong Huang, Wei Liu, Yi-Zhuo Wang, Wanshui Wu, Tianyou Wang, Rui Zhang, Zhigang Li

Notice bibliographique

RevueArchives of Pathology & Laboratory Medicine · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHistiocytic Disorders and Treatments
Établissements canadiensCAE (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésKRASV600ECancer researchMutationProtein kinase ABiologyOncogeneMedicineKinaseInternal medicineCancerGeneticsGeneCell cycle

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

CONTEXT.—: Langerhans cell histiocytosis (LCH) is a rare myeloid neoplasm that predominantly affects young children. OBJECTIVE.—: To investigate genetic alterations and their correlation with clinical characteristics and prognosis in pediatric LCH. DESIGN.—: We performed targeted sequencing to detect mutations in LCH lesions from pediatric patients. RESULTS.—: A total of 30 genomic alterations in 5 genes of the MAPK pathway were identified in 187 of 223 patients (83.9%). BRAF V600E (B-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinase) was the most common mutation (51.6%), followed by MAP2K1 (mitogen-activated protein kinase kinase 1) alterations (17.0%) and other BRAF mutations (13.0%). ARAF (A-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinase) and KRAS (KRAS proto-oncogene, GTPase) mutations were relatively rare (2.2% and 0.9%, respectively). Additionally, FNBP1 (formin-binding protein 1)::BRAF fusion and MAP3K10 (mitogen-activated protein kinase kinase 10) mutations A17T and R823C were identified in 1 case each, with possible constitutive activation of ERK1/2 phosphorylation. BRAF V600E was more frequent in patients with risk organ involvement, while MAP2K1 mutation was more prevalent in patients with single-system LCH (P = .001). BRAF V600E was associated with craniofacial bone, skin, liver, spleen, and ear involvement (all P < .05). Patients with other BRAF mutations had a higher proportion of spinal column involvement (P = .006). Univariate analysis showed a significant difference in progression-free survival among the 4 molecular subgroups for patients treated with first-line therapy (P = .02). According to multivariate analysis, risk organ involvement was the strongest independent adverse prognostic factor (hazard ratio, 8.854; P < .001); BRAF or MAP2K1 mutation was not an independent prognostic factor. CONCLUSIONS.—: Most pediatric patients with LCH carry somatic mutations involving the MAPK pathway, correlating with clinical characteristics and outcomes for first-line chemotherapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,028
Score d'incertitude au seuil0,483

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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