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Enregistrement W4396976983 · doi:10.26434/chemrxiv-2024-bmvt7

3’-O-β-Glycosylation of nucleoside analogues using a promiscuous bacterial glycosyltransferase

2024· preprint· en· W4396976983 sur OpenAlexaff
Jonathan P. Dolan, Tessa Keenan, Caecilie M. M. Benckendorff, Aisling Ní Cheallaigh, Martin A. Fascione, Gavin J. Miller

Notice bibliographique

RevueChemRxiv · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGlycosylationGlycosyltransferaseNucleosideChemistryBiochemistryBiologyEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Nucleoside analogue therapeutics have a proven capability within drug discovery as antimicrobial, antiviral and antineoplastic agents. However, their efficacy can be limited by poor cellular uptake, high off target toxicity and poor bioavailability. Prodrugs of such analogues contribute to an improved pharmacokinetic profile. Herein, we explore biocatalytic glycosylation of nucleoside analogues. The activity of the nucleoside-specific 3’-O-glycosyltransferase AvpGT from Streptomyces sp. AVP053U2 is investigated against a panel of both natural and clinically relevant purine and pyrimidine nucleoside analogues. AvpGT demonstrates broad substrate promiscuity, with 16 of 22 nucleosides tested showing glycosylation by HILIC-MS. Of these, 13 nucleosides were successfully glycosylated on 25 μmol scale in 39-91% yields, including four nucleoside analogue therapeutics. Furthermore, a novel β-glucosidase, AvpGS, was identified from the same Streptomyces sp. strain, heterologously expressed, purified and shown to display high substrate promiscuity in subsequently removing glucose from the glycoconjugates.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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