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Enregistrement W4396991704 · doi:10.1681/asn.20213210s1398d

Interaction/Modulation of PKD2 by TACAN

2021· article· en· W4396991704 sur OpenAlexaff
Xiong Liu, Mohammad Fatehi, Rui Zhang, Jingfeng Tang, Peter E. Light, Xing‐Zhen Chen

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Society of Nephrology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueReceptor Mechanisms and Signaling
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésModulation (music)MedicinePhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: TACAN (also named TMEM120A), recently reported as a mechanoand pain-sensing ion channel, is distributed in diverse non-neuronal tissues such as heart, intestine and kidney, which indicates its potential role besides pain sensation. Previous proteomic screenings suggested the presence of an interaction between PKD2 and TACAN. In this study, we investigated the physical and functional interaction between the two proteins. Methods: We employed mutagenesis, molecular cloning, co-immunoprecipitation, immunofluorescence, biotinylation, two-electrode voltage clamp in Xenopus oocytes to measure whole-cell currents and patch-clamp in Chinese hamster ovary (CHO) cells to measure single-channel currents. Results: We found that TACAN is co-localized and in complex with PKD2 in primary cilia of different kidney cell lines and oocytes. Using oocyte expression, we found that TACAN inhibits the channel activity of PKD2 gain-of-function mutant F604P. Using CHO cell expression, we found that TACAN inhibits both wild-type PKD2 and mutant F604P through reducing their single-channel conductance and open probability. Co-expression of TACAN significantly enhanced the sensitivity of PKD2 to stretch. Further, our data showed that while the first and last transmembrane domains (TM1 and TM6) of TACAN are involved in interaction with transmembrane domains of PKD2 only the TACAN TM6 is functionally relevant. Conclusions: Our study revealed inhibition of PKD2 channel activity through physical TACAN-PKD2 complexing and that TACAN, but not PKD2, mediates mechanosensitivity of the channel complex. Whether and how TACAN participates in the pore formation remains to be determined. Funding: Government Support - Non-U.S.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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