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Enregistrement W4396991829 · doi:10.1681/asn.20213210s1821c

Nile Red Fluorescence and Spectroscopy Reveal Unique Lipid Droplet Distribution and Physicochemical Changes in Glomerulonephritis

2021· article· en· W4396991829 sur OpenAlexaff
Jason T. Bau, Wulin Teo, Asha K. R. Swamy, Adrienne Kline, Hyunjae Chung, Kevin R. Chapman, Graciela Andonegui, Daniel A. Muruve, Peter K. Stys, Justin Chun

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Society of Nephrology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSpectroscopy Techniques in Biomedical and Chemical Research
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNile redFluorescence spectroscopyFluorescenceChemistryGlomerulonephritisSpectroscopyBiophysicsBiologyOpticsKidneyEndocrinologyPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Abnormalities in lipid deposition and lipid droplet (LD) accumulation have not been well established in glomerulonephritis (GN). Nile Red (NR), a well-known lipophilic stain for intracellular LDs, is a solvatochromic fluorophore that provides high-resolution spatial assessment of lipid distribution and chemistry. Solvatochromatic spectroscopy is a sensitive imaging modality with the potential to characterize the subtle, early changes in lipid chemistry associated with glomerular injury and disease. Methods: A total of 72 kidney biopsies of histologically diagnosed glomerular diseases including minimal change disease, membranous nephropathy, primary FSGS, class IV lupus nephritis (LN), ANCA-associated vasculitis, and IgA nephropathy (IgAN), and healthy tissue controls were retrieved from the Biobank for the Molecular Classification of Kidney Disease. Quantitative spectral analysis of NR emission patterns were performed on NR-stained biopsies to generate unique physicochemical profiles for each type of GNl. Segmented regions of biopsies (glomeruli, tubules, and interstitial) were imaged using confocal microscopy allowing for LD quantitatation using an algorithm developed in MATLAB. Results: Lipid droplet distribution greatly differed between the GN with IgAN and LN demonstrating the highest number LDs in glomeruli. By spectral analyses, control tissue showed significant differences in lipid polarity profile between histological compartments of the kidney (glomeruli, interstitium and tubules). Tubules consistently displayed more lipid rich domains compared to interstitial and glomerular regions. In diseased states, these patterns varied between GNs, with glomerular regions becoming more polar (for example in LN) and tubular regions (predominantly for IgAN). Within histologically identical disease types, we noted distinct populations based on lipid profiles, suggesting significant variance within GN. Conclusions: Nile Red spectral analysis of human kidney tissue provides unique insights into lipid physicochemical changes in GN. Marked variance within identical disease types suggests that histological determinants of GNs are limited and sensitive techniques such as high-resolution imaging and spectroscopy can identify earlier changes in disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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