MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4396993121 · doi:10.1681/asn.20213210s1677a

Is One Allele Enough to Cause APOL1-Associated Nephropathy?

2021· article· en· W4396993121 sur OpenAlexaboutno aff
Peace Johnson, Sindhura Bobba, Sravanthi Paluri, Gaurav Gupta

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Society of Nephrology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal Diseases and Glomerulopathies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAlleleNephropathyMedicineGeneticsInternal medicineBiologyEndocrinologyGeneDiabetes mellitus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: The high risk APOL1 genotype are associated with an increased risk of developing non-diabetic kidney disease. In the post-kidney transplant setting, a high-risk donor APOL1 genotype (but not recipient genotype) is associated with an increased risk of graft failure and proteinuria, indicating that it is local glomerular APOL1 gene expression that confers disease rather than systemic gene expression. Here, we present 2 patients that developed post-transplant focal segmental glomerulosclerosis (FSGS) after an initial diagnosis and treatment of Antibody-mediated rejection (AMR). Case Description: Two patients with end stage kidney disease, highly sensitized, received deceased donor kidney transplants from African American donors (one in 2019 and the other a regraft in 2020). Donors were without discernable proteinuria on urine dipstick. Initial post tranasplant courses were complicated by AMR treated as per center protocol. Tissue-based whole biopsy gene expression studies on kidney biopsy specimens (MMdx, using Molecular Microscope, Alberta, Canada) confirmed AMR along with grossly elevated interferon-γ gene expression. Subsequently each developed nephrotic range proteinuria with biopsy-confirmed FSGS and ongoing AMR . In both patients, in the absence of a prior history of FSGS and a delayed development of proteinuria in the first case (2019, patient1), an absence of recurrence in the first allograft in the second case (2020, patient2), a diagnosis of donor-derived APOL-1 nephropathy was considered and retrospective donor genotyping revealed the intermediate G1/G0 genotype. See Figure for more details. Discussion: We hypothesize that extreme local interferon-γ activation due to AMR was the primary trigger that could have resulted in local APOL-1 gene activation and subsequent podocytopathy. Similar data was recently reported by Shetty et al, in a kidney transplant patient with COVID associated collapsing nephropathy and G1/G0 donor genotype. Based upon these data we hypothesize that the G1/G0 genotype may represent intermediate risk for podocytopathies. Further research is needed in this area to confirm these initial associations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,017

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of the American Society of Nephrology→Même sujetRenal Diseases and Glomerulopathies→Travaux en français237 207→