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Enregistrement W4396993815 · doi:10.1681/asn.20213210s1170b

Defects in KIM-1-Mediated Phagocytosis Do Not Predispose to AKI in Humans

2021· article· en· W4396993815 sur OpenAlexaff
Rita S. Suri, Ji-Yun Lee, Matthew R. Ban, Bradly Shrum, Ola Z. Ismail, Qingyong Xu, Robert A. Hegele, Lakshman Gunaratnam

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Society of Nephrology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueComplement system in diseases
Établissements canadiensLawson Health Research InstituteWestern UniversityRobarts Clinical TrialsMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhagocytosisIntensive care medicineMedicineImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Phagocytosis of dying cells is critical for homeostasis and tissue repair. During renal injury, upregulation of kidney injury molecule-1 (KIM-1) transforms kidney epithelial cells into phagocytes which engulf apoptotic and necrotic cells. A mutation that impairs KIM-1 phagocytic function (mucin domain deletion) resulted in worse kidney dysfunction after ischemia-reperfusion-injury (IRI) in mice, but this has not been studied in humans. Methods: We expressed three common mucin domain nonsynonymous variants (rs12522248, rs45439103, rs6149307) of the human KIM-1 gene (HAVCR1) in human kidney cells. To test if impaired KIM-1-mediated phagocytosis predisposes to kidney dysfunction after IRI, we genotyped 627 consecutive kidney donors and assessed risk of delayed graft function in recipients. Results: Cells expressing these variants exhibited markedly reduced phagocytosis of apoptotic and necrotic cells, compared to cells expressing wild type KIM-1; rs6149307 showed the most severe defects (<5% phagocytosis vs. wild type). Surprisingly, the risk of delayed graft function in recipients of donor kidneys homozygous for rs6149307 was not significantly increased compared to recipients of donor kidneys with one or no copies (adjusted relative risk 1.0 [0.7-1.3]). Analysis of rs12522248 and rs45439103 yielded similar resutls. Conclusions: Contrary to murine models, these results suggest severe defects in KIM-1-mediated phagocytosis do not predispose to acute kidney dysfunction after IRI in humans. Funding: Government Support - Non-U.S.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,788
Score d'incertitude au seuil0,484

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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