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Enregistrement W4396994820 · doi:10.1681/asn.20213210s1527d

A Noncanonical Role for IRE1α in Podocyte Endoplasmic Reticulum (ER)-Phagy

2021· article· en· W4396994820 sur OpenAlexaff
José R. Navarro‐Betancourt, Joan Papillon, Julie Guillemette, Takao Iwawaki, Andrey V. Cybulsky

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Society of Nephrology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Kidney Cyst Diseases
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEndoplasmic reticulumPodocyteCell biologySTIM1MedicineBiologyInternal medicineKidneyProteinuria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Glomerular diseases involving podocyte (glomerular epithelial cell; GEC) injury feature endoplasmic reticulum (ER) stress and activation of the unfolded protein response (UPR). Inositol requiring enzyme-1α (IRE1α), a UPR transducer, mediates chaperone production and autophagy in podocytes during ER stress. Selective autophagy of the ER (ERphagy) is dependent on ER-resident adaptors (e.g. RTN3L) and is stimulated by ER stress. ER-derived coat protein complex II (COPII) vesicles may participate in the delivery of ER cargo to autophagosomes; however, regulation and importance of ERphagy in glomerular disease are not understood. Methods: We employed mice with podocyte-specific deletion of IRE1α and littermate controls. IRE1α knockout (KO) and control GECs were produced from these mice. GECs were incubated with tunicamycin (TM) to induce ER stress. Results: Mass spectrometry analysis of TM-stimulated control and IRE1α KO GECs showed that in addition to ER chaperones, proteins in the secretory pathway, including the COPII component Sec23B, were increased in an IRE1α-dependent manner. By immunoblotting, TM enhanced Sec23B and RTN3L expression in control, but not IRE1α KO GECs. By immunofluorescence microscopy, in control GECs, TM increased the biogenesis of LC3 and Sec23B particles, as well as colocalization of Sec23B with LC3 and RTN3L with LC3; increases were attenuated in IRE1α KO GECs. Thus, deletion of IRE1α impaired delivery of COPII vesicles and RTN3L-coated ER fragments to autophagosomes. Knockdown of Sec23B with siRNAs reduced autophagosome formation in TM-treated control GECs. After blocking protein synthesis with cycloheximide, TM stimulated degradation of RTN3L in control GECs, consistent with ERphagy flux, but RTN3L degradation was impaired in IRE1α KO cells. Similarly, TM induced degradation of α3,4,5 collagen IV in control, but not IRE1α KO GECs, suggesting that collagen IV is an IRE1α-dependent ERphagy substrate. In adriamycin nephrosis, where IRE1α activates an adaptive UPR and autophagy, expression of Sec23B and RTN3L was increased in glomeruli of control, but not IRE1α KO mice. Conclusions: During ER stress, IRE1α redirects a subset of Sec23B-positive COPII vesicles to deliver RTN3L-coated ER fragments to autophagosomes. ERphagy is a novel outcome of the IRE1α pathway in podocytes and may play a cytoprotective role in glomerular diseases. Funding: Government Support - Non-U.S.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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