MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4396998168 · doi:10.1681/asn.20203110s1660a

Identification of Novel Biomarkers and Pathways for Coronary Artery Calcification in Non-Diabetic Patients on Hemodialysis Using Metabolomic Profiling

2020· article· en· W4396998168 sur OpenAlexaff
Wei Chen, Jessica Fitzpatrick, Stephen M. Sozio, Bernard G. Jaar, Michelle M. Estrella, Dario F. Riascos‐Bernal, T. Wu, Yunping Qiu, Irwin J. Kurland, Ruth F. Dubin, Yabing Chen, Rulan S. Parekh, David A. Bushinsky, Nicholas Sibinga

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Society of Nephrology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueParathyroid Disorders and Treatments
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineHemodialysisMetabolomicsCoronary artery diseaseProfiling (computer programming)Internal medicineCardiologyBioinformaticsComputer scienceBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: A better understanding of pathophysiology involving coronary artery calcification (CAC) in hemodialysis (HD) patients will help to develop new therapies. We sought to identify the differences in metabolomics profiles between HD patients with and without CAC. Methods: This is a case-control study nested within a cohort of 568 incident HD patients from the Predictors of Arrhythmic and Cardiovascular Risk in ESRD (PACE) study. Cases were non-diabetics with a CAC score >100 (n=51), and controls were nondiabetics with a CAC score of 0 (n=48). We measured 452 serum metabolites in each participant using liquid chromatography-mass spectrometry. Metabolites and pathway scores were compared using Mann-Whitney U tests, partial least squares-discriminant analyses, and pathway enrichment analyses. Multiple logistic regression was used to examine the associations of key metabolites and pathways with CAC. Results: Cases had a median CAC score of 466 (IQR 246-981). Compared to controls, cases were older (64±13 vs. 42±12 years) and were less likely to be African American (51% vs. 94%). We identified three metabolites in bile acid synthesis (chenodeoxycholic, deoxycholic, and glycolithocholic acids) and one metabolic pathway (arginine/proline metabolism) that were associated with CAC. After adjusting for demographics, higher levels of chenodeoxycholic, deoxycholic, and glycolithocholic acids were associated with higher odds of having CAC. Comparing the third with the first tertile of each bile acid, the adjusted OR (95% CI) was 6.34 (1.12-36.06), 6.73 (1.20-37.82), and 8.53 (1.50-48.49), respectively. Using the first principal component (PC1) score, arginine/proline metabolism was associated with CAC after adjusting for demographics [OR: 1.83 (95% CI: 1.06-3.15) per 1 unit higher in PC1 score], and the association remained significant after additional adjustments for statin use. Conclusions: Among HD patients without diabetes mellitus, chenodeoxycholic, deoxycholic, and glycolithocholic acids may be potential biomarkers for CAC, and arginine/proline metabolism may emerge as a new pathway in the pathogenesis of CAC and could be a potential treatment target. Funding: NIDDK Support, Other NIH Support - National Center for Advancing Translational Science, Private Foundation Support

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of the American Society of Nephrology→Même sujetParathyroid Disorders and Treatments→Travaux en français237 207→