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Enregistrement W4397024262 · doi:10.1016/j.isci.2024.110021

ChatFFA: An ophthalmic chat system for unified vision-language understanding and question answering for fundus fluorescein angiography

2024· article· en· W4397024262 sur OpenAlexaff
Xiaolan Chen, Pusheng Xu, Y P Li, Weiyi Zhang, Mingguang He, Danli Shi

Notice bibliographique

RevueiScience · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRetinal Imaging and Analysis
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesHong Kong Polytechnic University
Mots-clésFluorescein angiographyFundus (uterus)FluoresceinFundus fluorescein angiographyOphthalmologyComputer scienceFluorescenceMedicineOpticsRetinalPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Existing automatic analysis of fundus fluorescein angiography (FFA) images faces limitations, including a predetermined set of possible image classifications and being confined to text-based question-answering (QA) approaches. This study aims to address these limitations by developing an end-to-end unified model that utilizes synthetic data to train a visual question-answering model for FFA images. To achieve this, we employed ChatGPT to generate 4,110,581 QA pairs for a large FFA dataset, which encompassed a total of 654,343 FFA images from 9,392 participants. We then fine-tuned the Bootstrapping Language-Image Pre-training (BLIP) framework to enable simultaneous handling of vision and language. The performance of the fine-tuned model (ChatFFA) was thoroughly evaluated through automated and manual assessments, as well as case studies based on an external validation set, demonstrating satisfactory results. In conclusion, our ChatFFA system paves the way for improved efficiency and feasibility in medical imaging analysis by leveraging generative large language models.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,013
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,046

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,013
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0030,003
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0140,007

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,352
Écart entre enseignants0,314 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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