Correlation of Donor-Derived Cell-Free DNA With Histology and Molecular Diagnoses of T-Cell Mediated Rejection in Kidney Transplant Biopsies
Notice bibliographique
Résumé
Background: We reported correlation of donor-derived cell-free DNA (dd-cfDNA) with histologic and molecular diagnosis (MMDx) of kidney transplant biopsies (Gupta et al, Transplantation 2021). Here we build on that initial cohort with a larger TCMR sample size and provide data on therapy and outcomes. Methods: We identified biopsies classified as TCMR by histology and/or MMDx. Those with viral/bacterial nephritis/mixed rejection were excluded. Prior to therapy fractional dd-cfDNA (%; Allosure) was measured. 37 such biopsies were divided into two groups, H+M+ (concomitant TCMR; N=18) and H+M- (discordant TCMR; N=19). Results: Median dd-cfDNA was lower (p=0.02) in H+M- (0.32%; IQR: 0.15-0.43) compared to H+M+ group (1.03%; IQR: 0.38-1.8). In histologic findings interstitial and tubular inflammation (i+t) (4.8±1.5 vs 3.3±1.2, p=0.002) was worse for H+M+ vs H+M-. A graded dose-response was seen between i+t and dd-cfDNA for H+M+ and not seen in H+M- (Figure 1a). Borderline/1A TCMR was seen frequently in the H+M- (16/19, 84%) while TCMR ≥1B was seen in the H+M+ group (12/18, 67%). MMDx scores for TCMR (0.50±0.29 vs 0.02±0.02, p<0.0001) and inflammation (4.6±2.1 vs -0.55±1.5, p<0.0001) were higher in the H+M+ vs H+M- group. eGFR at biopsy was worse in the H+M+ group (27±19ml/min) compared to the H+M- (40±23ml/min; p=0.06). A majority of H+M+ were treated (16/18; 89%; 14 rATG and 2 steroids only) and a minority of H+M- received steroids only (7/19; 37%). Despite this discrepancy, there was improvement in eGFR in both groups. At median follow-up of 14.7 months eGFR improved to 34±24ml/min in the H+M+ and 49.2±26ml/min in the H+M- group (Figure 1b). All 4 graft losses and one patient death was in the H+M+ group (p=0.02). Conclusions: We confirm our findings in patients with histologic TCMR absent on molecular gene expression is associated with low dd-cfDNA. Majority of patients had improvement in kidney function without targeted therapy. This may indicate low-grade TCMR is a ‘response to wounding’, rather than cognate allo-recognition.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».