MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4397040694 · doi:10.1681/asn.20233411s1585a

Genotype-Phenotype Associations in Patients with Congenital and Infantile Nephrotic Syndrome

2023· article· en· W4397040694 sur OpenAlexaff
Md S. Islam, William E. Smoyer, Tej K. Mattoo, Robert L. Myette, Scott E. Wenderfer, Mahmoud Kallash, Tetyana L. Vasylyeva

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Society of Nephrology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal Diseases and Glomerulopathies
Établissements canadiensBC Children's HospitalChildren's Hospital of Eastern Ontario
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNephrotic syndromePhenotypeCongenital nephrotic syndromeMedicineGenotypePediatricsGeneticsInternal medicineBiologyKidneyProteinuriaGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Congenital nephrotic syndrome (CNS) and infantile nephrotic syndrome (INS) are disorders of the slit diaphragm of podocytes in the glomerular basement membrane. CNS manifests during the first three months of life, and INS between 3-12 months. The clinical features of the diseases include nephrotic-range proteinuria, hypoalbuminemia, and edema. The most common causes of CNS and INS are mutations in the NPHS1 and NPHS2 genes encoding nephrin and podocin, respectively. This study aimed to establish specific genetic characteristics of CNS and INS and their clinical correlations in the North American population. Methods: Nine Pediatric Nephrology Research Consortium (PNRC) sites retrospectively reviewed charts of 36 patients born between 1998 and 2019 with CNS or INS and underwent genetic testing. ClinVar, SNP, and Human mutation database confirmed the mutation's pathogenicity. Results: NPHS1 mutations were more often seen in CNS patients (27/36; 75%), whereas the INS group had more frequent mutations of WT1 (3/11;27.2%) and NPHS2 (4/11;36.3%) genes. Among patients with NPHS1 mutations, the splice site had more mutations than the gene coding region, irrespective of the group. Among these mutations, IVS17-1 G>A splice mutation was found in 4 subjects that showed aggressive features of CNS. Interestingly, the mutation's pathogenicity was confirmed by ClinVar, SNP, and Human mutation database. In patients with CNS, the frequency (9/18;50%) of multiple mutations of the NPHS1 gene was higher than in the INS group (2/5;40%) and significantly associated with hyperproteinemia (p=0.021) and hypoalbuminemia (p=0.03). Albumin infusions were much more effective in CNS patients with NPHS2/WT1 mutations than those with NPHS1 mutations. In INS patients with WT1 mutations, albumin infusions were less effective in supporting serum albumin levels. Conclusions: Variations in splice sites, especially IVS17-1 G>A, and multiple mutations in the NPHS1 gene were associated with a more aggressive course of CNS in infants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of the American Society of Nephrology→Même sujetRenal Diseases and Glomerulopathies→Travaux en français237 207→