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Enregistrement W4397040884 · doi:10.1681/asn.20233411s133c

TGFβ Signaling Regulates Renal Patterning via Cadm1 During Nephrogenesis

2023· article· en· W4397040884 sur OpenAlexaff
Sara Qubisi, Norman D. Rosenblum

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Society of Nephrology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRenal and related cancers
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTransforming growth factorPodocyteEndocrinologyCancer researchInternal medicineCell biologyMedicineKidneyBiologyProteinuria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Impaired nephrogenesis affects kidney health, causing childhood CKD and increasing CKD risk in adults. Foxd1+ kidney stromal cells regulate nephron development by interacting with Six2+ nephrogenic precursors. Previously, we (Rowan CJ et al, Development, 2018) demonstrated that Hedgehog-GLI signaling in Foxd1+ stromal cells is required to promote murine nephrogenesis through TGFβ signaling, specifically via promoting the transformation of mesenchymal cells into epithelial cells (MET) in the Six2+ nephrogenic zone. However, the underlying molecular mechanisms that guide MET are incompletely defined. Here we aim to define molecular mechanisms by which TGFβ signaling regulates nephrogenesis. Methods: Whole-kidney RNA seq and single-cell RNA seq to examine Tgfβr2 deficiency in Foxd1+ stromal and Six2+ nephrogenic kidneys. We validated the bioinfrmatics data through immuno-staining and Western blot. Compound mutant mice were generated to investigate the deficiency of Cadm1 alone or both Tgfβr2 and Cadm1, followed by histological analysis, immunostaining, and nephron quantitation. Results: Whole-kidney RNA seq (n=4) and scRNA seq (n=169 cell, P<0.001) in Foxd1+ stromal and Six2+ nephrogenic Tgfβr2-deficient kidneys identified Cadm1 (P<0.00003,P<0.0013) in Foxd1+stromal cells as a TGFβ signaling downstream target. Western blot analysis in HEK-T293 cells (n=2) demonstrated that treatment with TGFβ1 induced CADM1 expression in a dose-dependent manner. Kidney tissue with Stromal and/or nephrogenic cell deficiency of Cadm1 exhibited normal nephrogenesis (n=2-3,P<0.01). Kidney tissue with deficiency of both Tgfβr2 and Cadm1 in Foxd1+ stroma exhibited renal hypodysplasia characterized by 32% reduction in kidney:body weight (n=6,P<0.0001), a 35% reduction in nephron number (n=3,P<0.05), expansion of Six2+ cells/UB tip (n=2,P<0.05), and loosely packed cortex and irregular stromal pattern (n=3). Similarly, kidney tissue with deficiency of both Tgfβr2 and Cadm1 in Six2+ nephrogenic cells exhibited renal hypodysplasia characterized by a 27% reduction in kidney:body weight (n=3,P<0.01), a 48% reduction in nephron number (n=2,P<0.05) and expansion of Six2+ cells/UB tip (n=3, P<0.01). Conclusions: We conclude that Cadm1 is required for normal nephrogenesis in mice. Further, our data suggest that CADM1 may play a role in regulating the epithelialization of nephrogenic precursors under the influence of TGFβ signaling Funding: Government Support - Non-U.S.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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