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Enregistrement W4397041614 · doi:10.1681/asn.20233411s1564a

The CPLANE Protein Fuzzy Regulates Primary Ciliogenesis Through Actin Remodeling

2023· article· en· W4397041614 sur OpenAlexaff
Rita K. Kalot, Sima Babayeva, Elena Torban

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Society of Nephrology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrotubule and mitosis dynamics
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCiliogenesisCell biologyPrimary (astronomy)CiliumActinBiologyChemistryInternal medicineEndocrinologyMedicinePhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Defects in primary cilia cause a set of diseases termed ciliopathies manifesting in developmental defects including cystic/dysplastic kidneys. Mutations in ciliogenesis and planar cell polarity (CPLANE) genes FUZZY, INTURNED, and WDPCP lead to a ciliopathy spectrum with abnormal kidney phenotypes. Although Fuzzy ortholog in D.Melanogaster was identified as a part of the planar cell polarity and actin regulatory pathway, its functions in primary cilia assembly and ciliopathies remain largely unknown. We hypothesize that Fuzzy modulates actin-assembly involved in primary cilia formation. Methods: The interactions between Fuzzy-Flag, p190A RhoGAP and IQGAP1-GFP were assessed by co-Immunoprecipitation. Rhotekin G protein-binding domain-eGFP biosensor in mutant and control mouse embryonic fibroblast (MEF) cells was used to measure RhoA activity. IQGAP1 was knocked down by siRNA in Retinal Pigmented Epithelial cells (RPE-1). Overexpression of Fuzzy-GFP was done by stable transfection in MDCK cells. Immunofluorescence with gamma-tubulin, Arl13b and phalloidin was used for cilia assessment. Results: We established that Fuzzy interacts with p190A RhoGAP and controls its localization to the basal body. Normally, p190ARhoAGAP localizes to the primary cilia base and inactivates the actin-regulating protein RhoA. However, in Fuzzy mutant cells, RhoA is excessively activated. We also demonstrate that Fuzzy interacts with IQGAP1 - a protein that facilitates the interaction between p190ARhoGAP and RhoA. siRNA-mediated knockdown of IQGAP1 negatively affected ciliogenesis in RPE-1 cells. On the other hand, we show that Fuzzy is involved in regulation of the early stages of ciliogenesis: the overexpression of Fuzzy in MDCK cells triggered earlier cortical actin clearing at the apical membrane and earlier ciliogenesis. Conclusions: We conclude that Fuzzy regulates the actin cytoskeleton at the primary cilium during the early and later stages of ciliogenesis. Fuzzy recruits p190A RhoGAP to the ciliary base and interacts with IQGAP1 resulting in the inhibition of RhoA and the suppression of excessive actin polymerization at the base of the cilium. Fuzzy is also involved in the process of actin clearing during the early stages of ciliogenesis, but the exact mechanism is yet to be elucidated. Funding: Government Support - Non-U.S.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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