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Enregistrement W4397041997 · doi:10.1681/asn.20233411s1432a

Clonal Hematopoiesis of Indeterminate Potential Is Associated with AKI

2023· article· en· W4397041997 sur OpenAlexaffabout
Caitlyn Vlasschaert, Bryan Kestenbaum, Samuel A. Silver, Jianchun Chen, Elvis A. Akwo, Pavan K. Bhatraju, Ming‐Zhi Zhang, Shirong Cao, Ming Jiang, Aolei Niu, Edward D. Siew, Holly Kramer, Anna Köttgen, Nora Franceschini, Bruce M. Psaty, Álvaro Alonso, Dan Arking, Josef Coresh, Christie M. Ballantyne, Morgan E. Grams, Matthew B. Lanktree, Michael J. Rauh, Alexander G. Bick, Raymond C. Harris, Cassianne Robinson‐Cohen

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Society of Nephrology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMyeloproliferative Neoplasms: Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensMcMaster UniversityQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIndeterminateHaematopoiesisMedicineIntensive care medicineStem cellBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Clonal hematopoiesis of indeterminate potential (CHIP) is a recently recognized risk factor for several chronic diseases of aging including cardiovascular disease and chronic kidney disease. In these contexts, clonal populations of mutated myeloid cells contribute to end-organ damage through inflammatory dysregulation. We recently identified CHIP as a novel risk factor for AKI: it was associated with an increased risk of incident AKI in ICD code-based prospective clinical data from three large cohorts totalling nearly half a million individuals (adjusted hazard ratio: 1.26, 95% CI: 1.19-1.34). Methods: In the current work, we sought to investigate determine whether CHIP was associated with impaired functional recovery from AKI. We first examined the association between CHIP and AKI recovery in the ASSESS-AKI cohort. We then assessed long-term post-AKI outcomes in a mouse model of CHIP (partial Tet2-/- bone marrow transplant) subjected to ischemia reperfusion injury. Results: We identified that certain subtypes of CHIP exhibited a non-resolving pattern of injury and had poorer long-term outcomes after AKI. At 28 days post-ischemic injury, we observed higher levels of kidney injury markers KIM-1 and NGAL as well as more kidney fibrosis in the CHIP mice compared to wild type mice. Kidney macrophage infiltration was markedly increased in CHIP mice at this timepoint, and concomitant upregulation of pro-inflammatory and fibrotic signaling pathways was noted. Conclusions: This work identifies CHIP as a novel and potentially targetable risk factor for impaired recovery from AKI. Funding: NIDDK Support, Other NIH Support - Canadian Institutes of Health Research Project Grant (application # 427810), R01DK132155, Government Support - Non-U.S.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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