MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4397045258 · doi:10.1681/asn.20233411s1118b

Role of KIM-1 and TBX1 in AKI to CKD Transition

2023· article· en· W4397045258 sur OpenAlexaff
Elena Tutunea-Fatan, Shabitha Arumugarajah, Lakshman Gunaratnam

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Society of Nephrology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRenal and related cancers
Établissements canadiensWestern UniversityLawson Health Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTransition (genetics)TBX1MedicineInternal medicineBiologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Acute kidney injury (AKI) affects 20% of hospitalized patients. The most common cause is renal ischemia-reperfusion injury (IRI). Patients who survive mild-to-moderate AKI often have complete renal recovery, but severe AKI can progress to the development of chronic kidney disease (CKD). Kidney Injury Molecule-1 (KIM-1) is a transmembrane receptor expressed by proximal tubular epithelial cells (PTECs) during injury. Notwithstanding that, severe AKI leads to persistent KIM-1 expression and drives renal fibrosis. Using microarray analysis, we identified T Box-1/TBX1 as a potential KIM-1 regulated gene that may mediate its maladaptive effects during severe AKI. Methods: KIM-1+/+ and KIM-1-/- C57BL/6 mice were subjected to sevre unilateral ischemia reperfusion injury (UIRI) by clamping the renal artery for 55 minutes. Kidneys were isolated after 7 and 42 days of reperfusion to assess histology and, markers of injury and fibrosis. RNA sequencing of kidneys from the KIM-1+/+ and KIM-1-/- mice after 55 min UIRI was performed. In order to assess the fibrogenic potential of TBX1 in vivo, Tamoxifen-inducible PTEC-specific TBX1 knockout (TBX1ptKO) mice were generated. In vitro model for gain of TBX1 function was created by using primary PTECs isolated from murine cortical kidney subjected to biochemical and functional assays. Results: Compared to the ipsilateral kidneys from KIM-1-/- mice, the kidneys from KIM-1+/+ mice were markedly shrunken and fibrotic at 42 days after UIRI. We also observed a significant upregulation of mRNA encoding a panel of pro-inflammatory cytokines and growth factors at both 7 and 42 days after UIRI in KIM-1+/+ kidney compared to KIM-1-/- kidneys. Primary PTECs isolated only from KIM-1+/+ kidneys significantly increased the chemotaxis of Raw macrophages whereas KIM-1+/+ PTECs became arrested at the G2/M phase of the cell cycle, and adopted a senescent phenotype. Conditional silencing of KIM-1 was associated with a significant reduction in TBX1 expression at both mRNA and protein levels. TBX1 expression profile positively correlated with fibrosis in KIM-1+/+ mice exposed to severe IRI. TBX1 enhanced PTEC migration, acquisition of a senescence phenotype, production of extracellular matrix and profibrotic factors. Conclusions: Our results suggest that sustained KIM-1 expression following severe AKI may drive murine kidney fibrosis due to activation of TBX1. Funding: Government Support - Non-U.S.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of the American Society of Nephrology→Même sujetRenal and related cancers→Travaux en français237 207→