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Enregistrement W4397046247 · doi:10.1681/asn.20223311s11a

Clonal Hematopoiesis of Indeterminate Potential Is Associated With a Higher Risk of Incident AKI

2022· article· en· W4397046247 sur OpenAlexaff
Caitlyn Vlasschaert, Alexander G. Bick, Michael J. Rauh, Matthew B. Lanktree, Morgan E. Grams, Bruce M. Psaty, Anna Köttgen, Nora Franceschini, Holly Kramer, Bryan Kestenbaum, Cassianne Robinson‐Cohen

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Society of Nephrology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMyeloproliferative Neoplasms: Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensMcMaster UniversityQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIndeterminateMedicineHaematopoiesisIntensive care medicineInternal medicineStem cellBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Clonal hematopoiesis of indeterminate potential (CHIP) is a common, age-related process wherein an acquired driver mutation in a hematopoietic stem cell produces a resilient clonal leukocyte population with dysregulated inflammatory signaling. The presence of CHIP has been associated with the progression of chronic kidney disease. We tested whether CHIP is a novel risk factor for acute kidney injury (AKI) in two community-based cohorts. Methods: We evaluated participants from the Atherosclerosis Risk in Community (ARIC; N = 10,570) and Cardiovascular Health Study (CHS; N = 2,792). We identified somatic DNA mutations in peripheral leukocytes that met established criteria for CHIP using whole exome and whole genome data. AKI events were previously ascertained in both cohorts based on hospitalization codes with additional validation by manual chart review in CHS. We used proportional hazards regression to test associations of CHIP with AKI after adjustment for relevant confounders. Results: CHIP was identified in 7.6% of ARIC participants (median age: 58) and 14.5% of CHS participants (median age: 72). The incidence rate of AKI was higher among persons with CHIP in both cohorts: 12.6 vs. 10.4 events per 1000 person-years in ARIC and 6.6 vs. 4.4 events per 1000 person-years in CHS. In a fixed-effects meta-analysis adjusted for age, age2, sex, and baseline eGFR, the presence of CHIP was associated with an estimated 18% greater risk of AKI (HR 1.18, 95% CI: 1.02 - 1.37). The risk for AKI was greatest for mutations in driver genes other than DNMT3A (non-DNMT3A CHIP; HR 1.29, 95% CI: 1.07 - 1.55). Conclusions: CHIP is associated with a greater risk of incident AKI in two large community-based cohorts. Non-DNMT3A CHIP mutations demonstrate the strongest associations with incident AKI. CHIP may therefore be a novel risk factor for AKI that could partially explain the strong age dependency of this condition. Future studies will elucidate which subtypes of CHIP pose the highest risk of kidney sequelae and in which scenarios emerging treatments for CHIP would be beneficial. Funding: Other NIH Support - NHLBI Trans-Omics for Precision Medicine

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,020

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,007
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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