MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4397047622 · doi:10.1093/sumbio/qvae012

Strategies for biofilm optimization of plastic-degrading microorganisms and isolating biofilm formers from plastic-contaminated environments

2024· article· en· W4397047622 sur OpenAlexfundno aff
Adam McFall, Scott A. Coughlin, Gary Hardiman, Julianne Megaw

Notice bibliographique

RevueSustainable Microbiology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicroplastics and Plastic Pollution
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilDirectorate for Biological SciencesAgri-Food and Biosciences InstituteQueen's UniversityQueen's University BelfastNorthern Ireland Environment Agency
Mots-clésBiofilmMicroorganismContaminationBiodegradable plasticMicrobiologyChemistryBiologyBacteriaEcologyOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The perpetual disposal of plastic waste, combined with ineffective waste management strategies, has resulted in widespread environmental plastic pollution. Microbial plastic biodegradation represents an emerging solution to this problem. However, biodegradation studies tend to overlook the fundamental prerequisite of initial surface colonization via biofilm formation. This study had two independent but connected aims relating to plastic surface colonization by microorganisms: to enhance biofilm formation by known plastic degraders, with translational potential for improved plastic degradation, and to isolate microorganisms from microplastic contaminated environments with the ability to colonize plastic surfaces. Planktonic and biofilm responses to diverse carbon and energy sources were investigated over 7 days, using Bacillus subtilis 168, Fusarium solani (Martius) Saccardo, Ideonella sakaiensis 201-F6, Pseudomonas putida KT2440, and Rhodococcus ruber C208. This enabled optimal conditions for biofilm formation by each strain to be determined. In parallel, environmental samples containing synthetic or natural polymeric substances (anaerobic digestate, landfill leachate, and microplastic contaminated compost) were incubated with polyethylene and polyethylene terephthalate films, to isolate microorganisms capable of colonizing their surfaces. This yielded eight bacterial isolates from three genera: Bacillus, Lysinibacillus, and Proteus. These genera contain species that have been shown to degrade plastics and other recalcitrant synthetic polymers, demonstrating the success of our approach. This study also suggests that discrete plastic types may create different ecological niches which can be exploited by unique bacterial colonizers. Our findings underscore the importance of considering plastic colonization by microbial biofilms in the context of their biodegradation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,196
Écart entre enseignants0,191 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueSustainable MicrobiologyMême sujetMicroplastics and Plastic PollutionTravaux en français237 207