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Enregistrement W4397047771 · doi:10.1681/asn.20223311s13a

Machine Learning Models Uncover Subphenotypes of AKI With Unique Signatures That Associate With Differing Clinical Outcomes

2022· article· en· W4397047771 sur OpenAlexaff
George Vasquez‐Rios, Won-Suk Oh, Samuel Lee, Pavan K. Bhatraju, Sherry G. Mansour, Dennis G. Moledina, Edward D. Siew, Amit X. Garg, Vernon M. Chinchilli, James S. Kaufman, Chi‐yuan Hsu, Kathleen D. Liu, Paul L. Kimmel, Alan S. Go, Mark M. Wurfel, Jonathan Himmelfarb, Chirag R. Parikh, Steven G. Coca, Girish N. Nadkarni

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Society of Nephrology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenin-Angiotensin System Studies
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicinePsychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Acute kidney injury (AKI) is defined through serum creatinine and urine output metrics. However, these markers do not capture the complexity of AKI and do not fully inform on the future risk of kidney and clinical events. Methods: We evaluated clinical and biomarker data from AKI patients during the acute hospitalization from ASSESS-AKI via three machine learning algorithms to uncover different AKI composites. We compared key characteristics within each subphenotype via classic statistics and then examined the time to event for kidney events (CKD incidence and progression), cardiovascular events, and death by subphenotype. Results: We included 748 AKI patients. The mean age (± SD) was 64 (13) years, 67.9% were men, and the median follow-up was 4.8 years. Patients with AKI subphenotype 1 (‘cardiorenal injury’, N=181) were characterized by prevalent CVD (78%, P<0.001) and the highest levels of KIM-1, urinary IL-18, and Troponin T. Subphenotype 2 (‘benign’, N=250) was comprised of individuals with a low prevalence of comorbid conditions and high uromodulin levels, a marker of tubular repair. AKI subphenotype 3 (‘cardiorenal inflammation, N=159) comprised patients with markedly high levels of pro-BNP, TNFRs and low kidney injury (KIM-1, NGAL). Finally, patients subphenotype 4 (‘sepsis-AKI’, N=158) had high rates of infections and dialysis-requiring AKI. These patients had the highest levels of vascular/kidney (YKL-40, MCP-1), and injury activity. AKI subphenotype 3 and 4 were independently associated with a higher risk of death: adjusted hazard ratios (aHR) of 2.9 (95% CI: 1.8 - 4.6, p<0.001) and 1.6 (1.01 - 2.6, p=0.04), respectively. Subphenotype 3 was also independently associated with triple the risk of CKD outcomes (aHR: 2.6, CI: 1.6 - 4.2) and CVD events (aHR: 2.6, CI: 1.6 - 4.1). Conclusions: We discovered four novel and clinically meaningful AKI subphenotypes that inform on potential pathway abnormalities that associate with differing risks for long-term events. We found a new role for biomarkers when they are evaluated in an agnostic fashion, which can serve to advance precision medicine in AKI care. Funding: NIDDK Support

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,490

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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