Impact of Uremia on Regulatory T Lymphocytes Proliferation and Phenotype
Notice bibliographique
Résumé
Background: Chronic kidney disease (CKD) patients have a dysfunctional immune system that is chronically and non-specifically activated, leading to low grade inflammation. Inflammation is now considered both a risk factor and a consequence of reduced kidney function and is highly associated with cardiovascular disease, which is the leading cause of mortality on dialysis. Regulatory T cells (Tregs) are important inhibitors of proinflammatory responses. While Tregs numbers are decreased in patients with CKD, their state and effectiveness remain poorly understood. We aim to investigate the impact of uremia on those cells. Methods: Tregs and conventional CD4+ cells from hemodialysis (HD) patients and healthy donors were fluorescence-activated cell sorting (FACS)-sorted and serum was collected. We analyzed the Treg transcriptome using single cell RNA sequencing (scRNA-seq). Tregs and conventional CD4+ T cells from healthy donors were also expanded invitro with media (IL-2 500U/mL) containing healthy donors' or HD patients' serum. After 7 and 12 days in culture, we used flow cytometry to compare changes in phenotype, viability, apoptosis and assess their function. Results: We identified 11 Treg clusters from the scRNA seq data. From those, one is more present in HD patients, irrespective of donor's sex (FDR <0.05 & abs(Log2FD)>0.26) and 3 less present in HD patients. In vitro cultures show decreased Tregs number in uremic serum after 7 days compared to healthy donors (fold expansion 11.35 vs 19.27; p<0.001) and no significant impact on conventional CD4+ T cells (fold expansion 17.88 vs 19.52; p=0.34). They were no significant differences in Treg expansion or function, as assessed by a suppression assay, after 12 days (p>0.99). Staining for apoptosis with Annexin V/PI indicate no difference in viability or apoptosis between serums after 7 and 12 days. Markers associated with Tregs functions and activation such as CTLA4, GARP, LAP, CD69 and CD71 were expressed similarly in HD and healthy donors' serum after 7 days (p=0.82, 0.77, 0.73, 0.23 and 0.44 respectively). Conclusions: Serum from HD patients selectively delays Tregs proliferation in vitro and not conventional CD4+ T cells, with no impact on cell death, activation and Tregs markers' expression. HD patients also have different Treg cluster composition. Further studies are needed to identify the causes and impacts of those changes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».