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Enregistrement W4397048009 · doi:10.1681/asn.20223311s1806b

Progression of Focal Segmental Glomerulosclerosis in Patients With High Risk APOL1 Genotypes: A CureGN Study

2022· article· en· W4397048009 sur OpenAlexaff
Mahmoud Kallash, Yujie Wang, Abigail R. Smith, Howard Trachtman, Carla Nester, Rasheed Gbadegesin, Pietro A. Canetta, Chen Wang, Tracy E. Hunley, C. John Sperati, David T. Selewski, Isabelle Ayoub, Tarak Srivastava, Amy K. Mottl, Jeffrey B. Kopp, Virginie Royal, Debbie S. Gipson, Jason M. Kidd

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Society of Nephrology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal Diseases and Glomerulopathies
Établissements canadiensHôpital Maisonneuve-Rosemont
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFocal segmental glomerulosclerosisMedicineGlomerulosclerosisGenotypeInternal medicinePathologyKidneyBiologyProteinuriaGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Polymorphism in APOL1 is a risk factor for disease progression in FSGS. This study evaluated the association of APOL1 genotypes on kidney disease progression in patients with FSGS. Methods: Cure Glomerulonephropathy participants with a biopsy diagnosis of FSGS were included. Whole genome sequencing was performed with 150 bp paired end reads on Illumina NovaSeq 6000 instruments targeting 30X read depth. eGFR decline was categorized as ≤-5, 0 to -5, and >0ml/min/yr. Multivariable ordinal logistic regression was used to assess the association with APOL1 high-risk (HR, 2 risk alleles) vs low risk (LR, 0-1 risk alleles). Results: Of 650 participants, 13% were HR, 60% were LR (APOL1 status missing for 27%, Table). HR participants' biopsies showed more collapsing FSGS (p<0.001), greater interstitial inflammation (p<0.001) and interstitial fibrosis and tubular atrophy (p=0.02). The odds of rapid progression was 2.76 times higher in the HR group after adjustment. Proteinuria at biopsy was not associated with progression category, however, within the first year post-enrollment, higher nadir proteinuria (OR=1.09, p=0.02), need for multiple immunosuppressive agents (OR=1.35, p=0.001) and uncontrolled hypertension (OR=1.61, p=0.04) were associated with rapid progression.Table:: Demographic and clinical characteristics of subjects per APOL1 status.Conclusions: In addition to APOL1 genotype, degree of proteinuria reduction, use of multiple immunosuppressive agents and uncontrolled hypertension are additional risk factors for rapid progression of FSGS. A better understanding of the natural history of FSGS in the context of high risk APOL1 genotypes will improve patient care and inform the design of interventional studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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