Progression of Focal Segmental Glomerulosclerosis in Patients With High Risk APOL1 Genotypes: A CureGN Study
Notice bibliographique
Résumé
Background: Polymorphism in APOL1 is a risk factor for disease progression in FSGS. This study evaluated the association of APOL1 genotypes on kidney disease progression in patients with FSGS. Methods: Cure Glomerulonephropathy participants with a biopsy diagnosis of FSGS were included. Whole genome sequencing was performed with 150 bp paired end reads on Illumina NovaSeq 6000 instruments targeting 30X read depth. eGFR decline was categorized as ≤-5, 0 to -5, and >0ml/min/yr. Multivariable ordinal logistic regression was used to assess the association with APOL1 high-risk (HR, 2 risk alleles) vs low risk (LR, 0-1 risk alleles). Results: Of 650 participants, 13% were HR, 60% were LR (APOL1 status missing for 27%, Table). HR participants' biopsies showed more collapsing FSGS (p<0.001), greater interstitial inflammation (p<0.001) and interstitial fibrosis and tubular atrophy (p=0.02). The odds of rapid progression was 2.76 times higher in the HR group after adjustment. Proteinuria at biopsy was not associated with progression category, however, within the first year post-enrollment, higher nadir proteinuria (OR=1.09, p=0.02), need for multiple immunosuppressive agents (OR=1.35, p=0.001) and uncontrolled hypertension (OR=1.61, p=0.04) were associated with rapid progression.Table:: Demographic and clinical characteristics of subjects per APOL1 status.Conclusions: In addition to APOL1 genotype, degree of proteinuria reduction, use of multiple immunosuppressive agents and uncontrolled hypertension are additional risk factors for rapid progression of FSGS. A better understanding of the natural history of FSGS in the context of high risk APOL1 genotypes will improve patient care and inform the design of interventional studies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».