Comment on egusphere-2024-497
Notice bibliographique
Résumé
Abstract. Neogloboquadrina pachyderma is the only true polar species of planktonic foraminifera. It therefore plays a crucial role in the calcite flux, and in reconstructions and modelling of seasonality and environmental change within the high latitudes. The rapidly changing environment of the polar regions of the North Atlantic and Arctic Oceans poses challenging conditions for this (sub)polar species in terms of temperature, sea-ice melt, calcite saturation, ocean pH and contraction of the polar ecosystem. To model the potential future for this important high latitude species, it is vital to investigate the modern ocean community structure throughout the annual cycle of the Arctic to understand the inter-dependencies of N. pachyderma. We use 16S rDNA metabarcoding and TEM to identify the microbial interactions of N. pachyderma during the summer ice-free conditions in Baffin Bay. We demonstrate that the N. pachyderma diet consists of diatoms and bacteria. The core microbiome is defined as the 16S rDNA amplicon sequencing variants (ASVs) found in 80 % of individuals investigated. This core microbiome consists of two diatom chloroplast ASVs and seven bacterial ASVs and accounts for, on average, 50 % of the total ASVs in any individual. The bacterial ASVs represent hydrocarbon-degrading bacteria, including those found routinely in the diatom phycosphere. On average the two chloroplast ASVs compose 40 % of the core microbiome. Significantly, an average of 55.7 % of all ASVs in any individual are of chloroplast origin. TEM highlights the importance of diatoms to this species, conclusively revealing that chloroplasts remain undigested in the foraminiferal cytoplasm in very high numbers, comparable to those observed in kleptoplastic benthic foraminifera. Diatoms are the major source of kleptoplasts in benthic foraminifera and other kleptoplastic groups, but this adaptation has never been observed in a planktonic foraminifer. Further work is required to understand the association between N. pachyderma, diatoms and their chloroplasts in the pelagic Arctic realm. It may confer an advantage to this species for survival in this extreme habitat, but it could also become compromised by the rapidly changing climate.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,011 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,003 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,012 | 0,006 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,533 | 0,363 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».