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Enregistrement W4398167114 · doi:10.1152/physiol.2024.39.s1.2238

Cells expressing POLG loss-of-function variants can decrease mtDNA copy number and increased growth rates in neighbouring A7r5 and HeLa cells

2024· article· en· W4398167114 sur OpenAlexaffabout
Damon Poburko, Samantha Rothwell, Omnia Taha, Irvin Ng, Angelica Baniqued, Italia Paris, Sophia Shalchy-Tabrizi

Notice bibliographique

RevuePhysiology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHeLaBiologyMitochondrial DNAGeneticsFunction (biology)Copy-number variationMolecular biologyGeneVirologyCell biologyCell cultureGenome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mitochondrial disfunction promotes vascular disease, and mitochondrial diseases offer valuable insights into the pathological mechanisms of mitochondrial dysfunction. We previously described a patient cohort with variants in the mitochondrial DNA gamma polymerase (POLG) that were prone hypertension. We hypothesized that the POLG variants promote hypertrophy or hyperplasia of vascular smooth muscle cells in a way that stiffens or thickens blood vessels to explain the high rate of resistant hypertension in this cohort. The objective of this study was to assess the cellular phenotype of cells over-expressing POLG variants: pathogenic Y955C and variants of unknown significance; R964C, I1098N, Y1138C. We transiently expressed human FLAG-tagged POLG variants in rat A7r5 and HeLa cells for 2-4 days. Transfection effciency ranged from 20-30% in A7r5 and >60% in HeLa cells. POLG variants increased cell density by nuclear counting (20-60%) and growth rates measured by 48-72 h of live-cell imaging (Y955C > R964C > I1089N » Y1138C). Compared to wild-type, Y955C and R964C reduced mtDNA copy number (mCN) measured by droplet digital PCR by 10-20%. Imaging mtDNA nucleoids (anti-dsDNA) and the FLAG-tag showed that reduced mCN was not restricted to transfected cells. Addition of a P2A-T2A-nuclear-EGFP to the POLG constructs demonstrated that faster growth rates were not specific to transfected cells. Resting and oligomycin-stimulated mitochondrial membrane potential imaged with TMRM were unaffected by Y955C and R964C. Mitochondrial ROS (mitoSox) was similar between cultures transfected with Wild-type versus POLG variants and lower than levels stimulated by antimycin-A’s inhibition of complex III. Notably, we found a linear relationship between mCN and cell density that was not simply due to smaller cell size at higher densities. Using Hoescht-33342 staining to assess cell cycle, no clear difference in cell-cycle distribution was evident in unsynchronized cultures. We conclude that modest reduction of mCN induces a mitogenic effect, likely via a diffusible messenger that further reduces mCN in a cell population. The signalling mechanism of this phenomenon remains to be identified, but our results confirm that POLG malfunction can alter smooth muscle physiology in a way that could support pathogenic vascular remodelling and could promote enhanced growth in cancerous cells. Funded by the Natural Sciences and Research Council of Canada. This is the full abstract presented at the American Physiology Summit 2024 meeting and is only available in HTML format. There are no additional versions or additional content available for this abstract. Physiology was not involved in the peer review process.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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Résumé présentoui

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