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Enregistrement W4398185916 · doi:10.1016/j.bioorg.2024.107464

Efficient conversion of hemoglobin to a non-vasoactive oxygen carrier by site-specific cross-linking with azido acyl methyl phosphates followed by bio-orthogonal CuAAC with a bis-alkyne

2024· article· en· W4398185916 sur OpenAlexafffund
Yuju Kim, L. HUANG, N. Wu, Ronald Kluger

Notice bibliographique

RevueBioorganic Chemistry · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHemoglobin structure and function
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Network for Research and Innovation in Machining Technology, Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésChemistryHemoglobinBlood substituteClick chemistryAzideCombinatorial chemistryOxygenStereochemistryBiochemistryOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

While cross-linked hemoglobin tetramers are functional acellular oxygen carriers, their ability to scavenge endogenous nitric oxide (NO) by endothelial pore penetration results in adverse cardiovascular effects. Animal studies established that cross-linked human hemoglobins, chemically joined into a double protein, avoid NO scavenging, presumably due to their larger size preventing penetration into endothelial regions that produce NO. In the present report, we utilize azide-containing acyl phosphate reagents to form cross-linked hemoglobins then bio-orthogonally click-couple them with a bis-alkyne (CuAAC). The production of these larger oxygen-carrying hemoglobin conjugates is obtained in high yields through subunit-specific cross-linking between each βLys82 ε-amino group. The methyl phosphate leaving groups provide electrostatically induced β-subunit site-selectivity, producing azido-cross-linked hemoglobin that undergoes highly efficient CuAAC compared with previous cross-linkers. The acyl phosphates also efficiently cross-link both T-state and R-state hemoglobin. The resulting bis- and tris-tetrameric hemoglobin conjugates exhibit oxygen affinity and cooperativity that are comparable to those of the native protein. The hemoglobin derivatives from the process we describe can function as sources of oxygen in biomedical applications, such as in ex-vivo donor organ perfusion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,000
Score d'incertitude au seuil0,001

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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