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Enregistrement W4398248309 · doi:10.1038/s41467-024-48852-7

ZO-1 interacts with YB-1 in endothelial cells to regulate stress granule formation during angiogenesis

2024· article· en· W4398248309 sur OpenAlexafffund
Yassine El Bakkouri, Rony Chidiac, Chantal Delisle, Jeanne Corriveau, Gaël Cagnone, Vanda Gaonac’h-Lovejoy, Ashley Chin, Éric Lécuyer, Stéphane Angers, Jean‐Sébastien Joyal, Ivan Topisirović, Laura Hulea, Alexandre Dubrac, Jean‐Philippe Gratton

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensHôpital Maisonneuve-RosemontMcGill UniversityCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineJewish General HospitalUniversity of TorontoMontreal Clinical Research InstituteUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéGovernment of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchCancer Research Society
Mots-clésDownregulation and upregulationCell biologyAngiogenesisStress granuleInteractomeEndothelial stem cellBiologyChemistryCancer researchMessenger RNABiochemistryTranslation (biology)In vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Zonula occludens-1 (ZO-1) is involved in the regulation of cell-cell junctions between endothelial cells (ECs). Here we identify the ZO-1 protein interactome and uncover ZO-1 interactions with RNA-binding proteins that are part of stress granules (SGs). Downregulation of ZO-1 increased SG formation in response to stress and protected ECs from cellular insults. The ZO-1 interactome uncovered an association between ZO-1 and Y-box binding protein 1 (YB-1), a constituent of SGs. Arsenite treatment of ECs decreased the interaction between ZO-1 and YB-1, and drove SG assembly. YB-1 expression is essential for SG formation and for the cytoprotective effects induced by ZO-1 downregulation. In the developing retinal vascular plexus of newborn mice, ECs at the front of growing vessels express less ZO-1 but display more YB-1-positive granules than ECs located in the vascular plexus. Endothelial-specific deletion of ZO-1 in mice at post-natal day 7 markedly increased the presence of YB-1-positive granules in ECs of retinal blood vessels, altered tip EC morphology and vascular patterning, resulting in aberrant endothelial proliferation, and arrest in the expansion of the retinal vasculature. Our findings suggest that, through its interaction with YB-1, ZO-1 controls SG formation and the response of ECs to stress during angiogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,278 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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