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Enregistrement W4398250977 · doi:10.1136/jnnp-2024-333532

Algorithmic approach to finding people with multiple sclerosis using routine healthcare data in Wales

2024· article· en· W4398250977 sur OpenAlexaff
Richard Nicholas, Emma Tallantyre, James Witts, Ruth Ann Marrie, Elaine Craig, Sarah Knowles, Owen Pearson, Katherine Harding, Karim L. Kreft, Jonathan Hawken, Gillian Ingram, Bethan Morgan, Rod Middleton, Neil P. Robertson

Notice bibliographique

RevueJournal of Neurology Neurosurgery & Psychiatry · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMultiple Sclerosis Research Studies
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilMultiple Sclerosis Society
Mots-clésMedicineEpidemiologyPopulationRecord linkageCohortHealth careIdentification (biology)Retrospective cohort studyData miningFamily medicinePediatricsComputer sciencePathologyEnvironmental health

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Identification of multiple sclerosis (MS) cases in routine healthcare data repositories remains challenging. MS can have a protracted diagnostic process and is rarely identified as a primary reason for admission to the hospital. Difficulties in identification are compounded in systems that do not include insurance or payer information concerning drug treatments or non-notifiable disease. AIM: To develop an algorithm to reliably identify MS cases within a national health data bank. METHOD: Retrospective analysis of the Secure Anonymised Information Linkage (SAIL) databank was used to identify MS cases using a novel algorithm. Sensitivity and specificity were tested using two existing independent MS datasets, one clinically validated and population-based and a second from a self-registered MS national registry. RESULTS: From 4 757 428 records, the algorithm identified 6194 living cases of MS within Wales on 31 December 2020 (prevalence 221.65 (95% CI 216.17 to 227.24) per 100 000). Case-finding sensitivity and specificity were 96.8% and 99.9% for the clinically validated population-based cohort and sensitivity was 96.7% for the self-declared registry population. DISCUSSION: The algorithm successfully identified MS cases within the SAIL databank with high sensitivity and specificity, verified by two independent populations and has important utility in large-scale epidemiological studies of MS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,010
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,039
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,051

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0100,039
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0050,003
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,001
Science ouverte0,0020,003
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,142
Tête enseignante GPT0,350
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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