MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4398253289 · doi:10.1101/2024.05.22.595233

A single-cell eQTL atlas of the human cerebellum reveals vulnerability of oligodendrocytes in essential tremor

2024· preprint· en· W4398253289 sur OpenAlexaff
Charles-Etienne Castonguay, Farah Aboasali, Miranda Medeiros, Théodore Becret, Zoe Schmilovich, Anouar Khayachi, Alex Rajput, Patrick A. Dion, Guy A. Rouleau

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurogenesis and neuroplasticity mechanisms
Établissements canadiensUniversity of SaskatchewanUniversité de MontréalMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAtlas (anatomy)Vulnerability (computing)CerebellumNeuroscienceBiologyComputer scienceAnatomyComputer security

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Essential tremor (ET) is a movement disorder characterized by an upper-limb postural and action tremor. It is one of the most common neurological disorders, affecting 1% of the worldwide population. Despite strong evidence for genetic factors driving the aetiology of ET, the underlying pathophysiology remains poorly understood. To understand the effects of genetic risk factors in ET on the cerebellum, the brain region thought to be affected by the disease, we built a population-scale single-cell atlas of the human cerebellar cortex comprised of over 1 million cells from 109 individuals. Using single-cell expression quantitative trait loci and mendelian randomization, we found evidence of ET-associated variants in the BACE2 locus causally linked to its downregulation in cerebellar oligodendrocytes. We highlight a genetically vulnerable population of BACE2- expressing immature oligodendrocytes, suggestive of demyelination. We also find dysfunctional processes affecting interactions between Golgi cells, Purkinje layer interneurons, and oligodendrocytes in ET. Our study suggests a crucial role for cerebellar oligodendrocytes in the pathogenesis of ET.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,017

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)→Même sujetNeurogenesis and neuroplasticity mechanisms→Travaux en français237 207→