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Enregistrement W4398256031 · doi:10.1084/jem.20232005

Large-scale mutational analysis identifies UNC93B1 variants that drive TLR-mediated autoimmunity in mice and humans

2024· article· en· W4398256031 sur OpenAlexaff
Victoria E. Rael, Julian A. Yano, John Huizar, Leianna C. Slayden, Madeleine A. Weiss, Elizabeth A Turcotte, J M Terry, Wenqi Zuo, Isabelle Thiffault, Tomi Pastinen, Emily Farrow, Janda Jenkins, Mara L. Becker, Stephen C. Wong, Anne M. Stevens, Catherine Otten, Eric J. Allenspach, Devon Bonner, Jonathan A. Bernstein, Matthew T. Wheeler, Robert A. Saxton, Maria T. Acosta, David R. Adams, Raquel L. Alvarez, Justin Alvey, Aimee Allworth, Ashley Andrews, Euan A. Ashley, Ben Afzali, Carlos A. Bacino, Güney Bademci, Ashok Balasubramanyam, Dustin Baldridge, Jim Bale, Michael J. Bamshad, Deborah Barbouth, Pınar Bayrak‐Toydemir, Anita E. Beck, Alan H. Beggs, Edward M. Behrens, Gill Bejerano, Hugo J. Bellen, Jimmy Bennett, Gerard T. Berry, Anna Bican, Stephanie Bivona, Elizabeth Blue, John Bohnsack, Lorenzo D. Botto, Lauren C. Briere, Gabrielle Brown, Elizabeth A. Burke, Lindsay C. Burrage, Manish J. Butte, Peter H. Byers, William E. Byrd, John M. Carey, Thomas Cassini, Sirisak Chanprasert, Hsiao‐Tuan Chao, Iván K. Chinn, Gary Clark, Terra R. Coakley, Laurel A. Cobban, Joy D. Cogan, Matthew Coggins, F. Sessions Cole, Heather A. Colley, Rosario I. Corona, William J. Craigen, Andrew B. Crouse, Michael L. Cunningham, Precilla D’Souza, Hongzheng Dai, Surendra Dasari, Joie Davis, Jyoti G. Dayal, Margaret Delgado, Esteban C. Dell’Angelica, Katrina M. Dipple, Daniel Doherty, Naghmeh Dorrani, Argenia L. Doss, Emilie D. Douine, Dawn Earl, David J. Eckstein, Lisa Emrick, Christine M. Eng, Marni J. Falk, Elizabeth L. Fieg, Paul G. Fisher, Brent L. Fogel, Jiayu Fu, William A. Gahl, I. S. Glass, Pagé C. Goddard, Rena A. Godfrey, Andrea Gropman, Meghan C. Halley, Rizwan Hamid, Neal Hanchard, Kelly Hassey, Nichole Hayes, Frances A. High, Anne Hing, Fuki M. Hisama, Ingrid A. Holm, Jason Hom, Martha Horike‐Pyne, Alden Huang, Yan Huang, Sarah Hutchison, Wendy J. Introne, Kosuke Izumi, Gail P. Jarvik, Jeffrey G. Jarvik, Suman Jayadev, Orpa Jean-Marie, Vaidehi Jobanputra, Emerald Kaitryn, Shamika Ketkar, Dana Kiley, Gonench Kilich, Shilpa N. Kobren, Isaac S. Kohane, Jennefer N. Kohler, Susan Korrick, Deborah Krakow, Donna M. Krasnewich, Elijah Kravets, Seema R. Lalani, Christina Lam, Brendan C. Lanpher, Ian R. Lanza, Kimberly LeBlanc, Brendan Lee, Richard A. Lewis, Pengfei Liu, Nicola Longo, Sandra K. Loo, Joseph Loscalzo, Richard L. Maas, Ellen F. Macnamara, Calum A. MacRae, Valerie V. Maduro, AudreyStephannie Maghiro, Rachel Mahoney, May Christine V. Malicdan, Laura A. Mamounas, Teri A. Manolio, Rong Mao, Ronit Marom, Gábor Marth, Beth A. Martin, Martin G. Martin, Julián A. Martínez-Agosto, Shruti Marwaha, Allyn McConkie‐Rosell, Alexa T. McCray, Elisabeth McGee, Matthew Might, Mohamad A. Mikati, Danny E. Miller, Ghayda Mirzaa, Éva Morava, Paolo Moretti, Marie Morimoto, John J. Mulvihill, Mariko Nakano‐Okuno, Stanley F. Nelson, Shirley Nieves‐Rodriguez, Donna Novacic, Devin Oglesbee, James P. Orengo, Laura Pace, Stephen Pak, J. Carl Pallais, Jeanette C. Papp, Neil H. Parker, Leoyklang Petcharet, John A. Phillips, Jennifer E. Posey, Lorraine Potocki, Barbara N. Pusey Swerdzewski, Aaron R. Quinlan, Deepak A. Rao, Anna Raper, Wendy H. Raskind, Genecee Renteria, Chloe M. Reuter, Lynette Rives, Amy K. Robertson, Lance H. Rodan, Jill A. Rosenfeld, Elizabeth M. Rosenthal, Francis Rossignol, Maura Ruzhnikov, Marla Sabaii, Jacinda B. Sampson, Timothy Schedl, Kelly Schoch, Daryl A. Scott, Elaine Seto, Prashant Sharma, Vandana Shashi, Emily Shelkowitz, Sam Sheppeard, Jimann Shin, Edwin K. Silverman, Janet S. Sinsheimer, Kathy Sisco, Kevin S. Smith, Lilianna Solnica‐Krezel, Ben Solomon, Rebecca C. Spillmann, Andrew B. Stergachis, Joan M. Stoler, Kathleen E. Sullivan, Shirley Sutton, David A. Sweetser, Virginia P. Sybert, Holly K. Tabor, Queenie K.‐G. Tan, Amelia L.M. Tan, Arjun Tarakad, Herman A. Taylor, Mustafa Tekin, Willa Thorson, Cynthia J. Tifft, Camilo Toro, Alyssa A. Tran, Rachel A. Ungar, Tiina K. Urv, Adeline Vanderver, Matt Velinder, Dave Viskochil, Tiphanie P. Vogel, Colleen E. Wahl, Melissa Walker, Jennifer Wambach, Jijun Wan, Lee-kai Wang, Michael F. Wangler, Patricia A. Ward, Daniel Wegner, Monika Weisz Hubshman, Mark H. Wener, Tara Wenger, Monte Westerfield, Jordan Whitlock, Lynne A. Wolfe, Kim C. Worley, Shinya Yamamoto, Zhe Zhang, Stephan Züchner, Bo Liu, Olivia Majer, Gregory M. Barton

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Experimental Medicine · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Response and Inflammation
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesCommon FundOffice of Strategic CoordinationNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesHoward Hughes Medical InstituteLupus Research InstituteNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNIH Office of the DirectorNational Human Genome Research InstituteCenters for Disease Control and Prevention FoundationNational Science FoundationLupus Research AllianceNational Institutes of HealthChildren's Mercy HospitalCenters for Disease Control and Prevention
Mots-clésTLR7AutoimmunityBiologyImmunologyTLR3Autoimmune diseaseInnate immune systemToll-like receptorImmune systemAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Nucleic acid-sensing Toll-like receptors (TLR) 3, 7/8, and 9 are key innate immune sensors whose activities must be tightly regulated to prevent systemic autoimmune or autoinflammatory disease or virus-associated immunopathology. Here, we report a systematic scanning-alanine mutagenesis screen of all cytosolic and luminal residues of the TLR chaperone protein UNC93B1, which identified both negative and positive regulatory regions affecting TLR3, TLR7, and TLR9 responses. We subsequently identified two families harboring heterozygous coding mutations in UNC93B1, UNC93B1+/T93I and UNC93B1+/R336C, both in key negative regulatory regions identified in our screen. These patients presented with cutaneous tumid lupus and juvenile idiopathic arthritis plus neuroinflammatory disease, respectively. Disruption of UNC93B1-mediated regulation by these mutations led to enhanced TLR7/8 responses, and both variants resulted in systemic autoimmune or inflammatory disease when introduced into mice via genome editing. Altogether, our results implicate the UNC93B1-TLR7/8 axis in human monogenic autoimmune diseases and provide a functional resource to assess the impact of yet-to-be-reported UNC93B1 mutations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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