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Enregistrement W4398256209 · doi:10.1101/2024.05.22.24307764

XplainScar: Explainable Artificial Intelligence to Identify and Localize Left Ventricular Scar in Hypertrophic Cardiomyopathy from 12-lead Electrocardiogram

2024· preprint· en· W4398256209 sur OpenAlexaff
Kasra Nezamabadi, Sanjay Sivalokanathan, Ji Won Lee, Talha Tanriverdi, Meiling Chen, Dai‐Yin Lu, Jadyn Abraham, Neda Sardaripour, Pengyuan Li, Parvin Mousavi, M. Roselle Abraham

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiomyopathy and Myosin Studies
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHypertrophic cardiomyopathyCardiologyInternal medicineMedicineCardiomyopathyArtificial intelligenceComputer scienceHeart failure

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Left ventricular (LV) scar is a risk factor for sudden cardiac death and heart failure in hypertrophic cardiomyopathy (HCM). LV scar is frequent in HCM and evolves over time. Hence there is a need for LV scar detection and longitudinal monitoring. The current gold standard for LV scar detection is late gadolinium enhancement (LGE) on magnetic resonance imaging (MRI), which is limited by high cost and susceptibility to artifacts from implanted defibrillators. We introduce XplainScar , the first explainable machine learning method for LV scar detection and localization in HCM, using 12-lead electrocardiogram (ECG) data, which is not influenced by implanted devices. We use 500 patients from the JH-HCM Registry for model development, and 248 patients from the UCSF-HCM-Registry for validation. XplainScar combines unsupervised and self-supervised ECG representation learning, resulting in high precision (90%), sensitivity (95%), specificity (80%) and F1-score (90%) for scar detection in the basal, mid, and apical LV myocardium, with a processing time of <1 minute per 10 patients. Basal LV scar prediction by XplainScar is dominated by QRS features, and mid/apical LV scar by T wave features. XplainScar generalizes well to the held-out test UCSF data, with 88% precision, 90% sensitivity, 78% specificity, and F1-score of 89%. In summary, XplainScar demonstrates good performance for LV scar detection, and provides ECG signatures of basal, mid, and apical LV scar in HCM. XplainScar is publicly available at https://github.com/KasraNezamabadi/XplainScar

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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