Replication Data for: Systemic Inflammation is Negatively Associated with Early Post Discharge Growth following Acute Illness among Severely Malnourished Children- a Pilot Study
Notice bibliographique
Résumé
This is a replication dataset for the published paper "Systemic Inflammation is Negatively Associated with Early Post Discharge Growth following Acute Illness among Severely Malnourished Children- a Pilot Study" published in the Wellcome Open Research journal. This was a secondary analysis of data from a nested case control study within a clinical trial (NCT00934492) that tested the efficacy of daily co‐trimoxazole prophylaxis in reducing post‐discharge mortality among HIV‐uninfected children aged 2-59 months hospitalised with Complicated Severe Malnutrition (CSM) in two urban (Mombasa and Nairobi) and two rural (Kilifi and Malindi) hospitals in Kenya. We examined the relationship between changes in absolute deficits in weight and mid-upper-arm circumference (MUAC) from enrolment at stabilisation to 60 days later and untargeted plasma proteome, targeted cytokines/chemokines, leptin, and soluble CD14 (sCD14) using multivariate regularized linear regression. Dataset files included : (i) Njunge_CTX_15092020.dta and (ii) Njunge_CTX_15092020.csv Both files contain similar infomation. The files contains athropometric at the time of hospital discharge and during follow up months 1, 2, 3, 4, 5, 6, 8, 10, and 12. A full blood count at enrolment, 2, 6, and 12 months. Anthropometric z scores calculated using 2006 WHO growth references. Study data were entered into OpenClinical trial database. After locking the trial database, the data were extrcated and exported to STATA Version 13.1 for statistical analysis. Participants included in this study were non-oedematous children with Severe Malnutrition randomly selected from those who survived and were not readmitted to hospital during 12 months of follow up and had completed follow-up data at month 12. They had served as controls in a previous case control study (Njunge, J.M., et al., 2019. Biomarkers of post-discharge mortality among children with complicated severe acute malnutrition. Scientific reports, 9(1):5981. https://doi.org/1038/s41598-019-42436-y.) in which plasma proteomic and cytokine measurements had been done on enrolment samples. Absolute deficit in anthropometric variables were defined as the median value for age according to WHO growth charts minus the child’s measured value. The files also contain plasma proteome, leptin, sCD14 and a panel of targeted cytokines. The two files were generated using STATA/IC (version 15.1; StataCorp, College Station, TX, USA).
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,011 | 0,055 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,055 | 0,014 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».