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Enregistrement W4398748283 · doi:10.1093/ibd/izae085

Challenges in IBD Research 2024: Environmental Triggers

2024· review· en· W4398748283 sur OpenAlexaff
Ashwin N. Ananthakrishnan, Konstantinos Gerasimidis, Shuk-Mei Ho, Emeran A. Mayer, Jennifer S. Pollock, Shefali Soni, Gary D. Wu, Jalil Benyacoub, B.E. Ali, Alex Favreau, Denise Elsbree Smith, Jieun Oh, Caren Heller, Andres Hurtado‐Lorenzo, Alan Moss, Ken Croitoru

Notice bibliographique

RevueInflammatory Bowel Diseases · 2024
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensUniversity of TorontoMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésWorkgroupEnvironmental epidemiologyEnvironmental healthDiseaseInflammatory bowel diseaseEpidemiologyMedicineUlcerative colitisPsychological interventionVedolizumabPathologyComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Environmental factors play an important role in inflammatory bowel diseases (IBD; Crohn's disease, [CD], ulcerative colitis [UC]). As part of the Crohn's & Colitis Challenges 2024 agenda, the Environmental Triggers workgroup summarized the progress made in the field of environmental impact on IBD since the last Challenges cycle in this document. The workgroup identified 4 unmet gaps in this content area pertaining to 4 broad categories: (1) Epidemiology; (2) Exposomics and environmental measurement; (3) Biologic mechanisms; and (4) Interventions and Implementation. Within epidemiology, the biggest unmet gaps were in the study of environmental factors in understudied populations including racial and ethnic minority groups and in populations witnessing rapid rise in disease incidence globally. The workgroup also identified a lack of robust knowledge of how environmental factors may impact difference stages of the disease and for different disease-related end points. Leveraging existing cohorts and targeted new prospective studies were felt to be an important need for the field. The workgroup identified the limitations of traditional questionnaire-based assessment of environmental exposure and placed high priority on the identification of measurable biomarkers that can quantify cross-sectional and longitudinal environmental exposure. This would, in turn, allow for identifying the biologic mechanisms of influence of environmental factors on IBD and understand the heterogeneity in effect of such influences. Finally, the working group emphasized the importance of generating high-quality data on effective environmental modification on an individual and societal level, and the importance of scalable and sustainable methods to deliver such changes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,148
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,146
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,148
Score d'incertitude au seuil0,784

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1480,146
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,004
Bibliométrie0,0030,004
Études des sciences et des technologies0,0050,007
Communication savante0,0140,016
Science ouverte0,0040,012
Intégrité de la recherche0,0130,020
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0170,007

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,063
Tête enseignante GPT0,345
Écart entre enseignants0,282 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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