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Enregistrement W4398748689 · doi:10.1093/ibd/izae084

Challenges in IBD Research 2024: Precision Medicine

2024· review· en· W4398748689 sur OpenAlexaff
Sana Syed, Brigid S. Boland, Lauren T Bourke, Lea Ann Chen, Laurie Churchill, Angela Dobes, A. Greene, Caren Heller, Christina Jayson, Benjamin Kostiuk, Alan C. Moss, Fedaa Najdawi, Lori Plung, John D. Rioux, Michael J. Rosen, Joana Torres, Fatima Zulqarnain, Jack Satsangi

Notice bibliographique

RevueInflammatory Bowel Diseases · 2024
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensUniversité de MontréalMontreal Heart Institute
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases
Mots-clésWorkgroupMultidisciplinary approachMedicineBiomarker discoveryPrecision medicineData scienceTranslational researchBest practiceResource (disambiguation)Management scienceComputer sciencePathologyEngineeringPolitical science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Precision medicine is part of 5 focus areas of the Challenges in IBD Research 2024 research document, which also includes preclinical human IBD mechanisms, environmental triggers, novel technologies, and pragmatic clinical research. Building on Challenges in IBD Research 2019, the current Challenges aims to provide a comprehensive overview of current gaps in inflammatory bowel diseases (IBDs) research and deliver actionable approaches to address them with a focus on how these gaps can lead to advancements in interception, remission, and restoration for these diseases. The document is the result of multidisciplinary input from scientists, clinicians, patients, and funders, and represents a valuable resource for patient-centric research prioritization. In particular, the precision medicine section is focused on the main research gaps in elucidating how to bring the best care to the individual patient in IBD. Research gaps were identified in biomarker discovery and validation for predicting disease progression and choosing the most appropriate treatment for each patient. Other gaps were identified in making the best use of existing patient biosamples and clinical data, developing new technologies to analyze large datasets, and overcoming regulatory and payer hurdles to enable clinical use of biomarkers. To address these gaps, the Workgroup suggests focusing on thoroughly validating existing candidate biomarkers, using best-in-class data generation and analysis tools, and establishing cross-disciplinary teams to tackle regulatory hurdles as early as possible. Altogether, the precision medicine group recognizes the importance of bringing basic scientific biomarker discovery and translating it into the clinic to help improve the lives of IBD patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,135
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,138
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,135
Score d'incertitude au seuil0,713

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1350,138
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,004
Bibliométrie0,0050,004
Études des sciences et des technologies0,0050,013
Communication savante0,0220,024
Science ouverte0,0050,012
Intégrité de la recherche0,0150,032
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0240,015

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,093
Tête enseignante GPT0,389
Écart entre enseignants0,296 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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