Development of a decision support tool to compare diagnostic strategies for establishing the herd status for infectious diseases: An example with Salmonella Dublin infection in dairies
Notice bibliographique
Résumé
The diagnosis of infectious diseases at herd level can be challenging as different stakeholders can have conflicting priorities. The current study proposes a "proof of concept" of an approach that considers a reasonable number of criteria to rank plausible diagnostic strategies using multi-criteria decision analysis (MCDA) methods. The example of Salmonella Dublin diagnostic in Québec dairy herds is presented according to two epidemiological contexts: (i) in herds with no history of S. Dublin infection and absence of clinical signs, (ii) in herds with a previous history of infection, but absence of clinical signs at the moment of testing. Multiple multiparty exchanges were conducted to determine: 1) stakeholders' groups; 2) the decision problem; 3) solutions to the problem (options) or diagnostic strategies to be ordered; 4) criteria and indicators; 5) criteria weights; 6) the construction of a performance matrix for each option; 7) the multi-criteria analyses using the visual preference ranking organization method for enrichment of evaluations approach; 8) the sensitivity analyses, and 9) the final decision. A total of nine people from four Québec's organizations (the dairy producers provincial association along with the DHI company, the ministry of agriculture, the association of veterinary practitioners, and experts in epidemiology) composed the MCDA team. The decision problem was "What is the optimal diagnostic strategy for establishing the status of a dairy herd for S. Dublin infection when there are no clinical signs of infection?". Fourteen diagnostic strategies composed of the three following parameters were considered: 1) biological samples (bulk tank milk or blood from 10 heifers aged over three months); 2) sampling frequencies (one to three samples collection visits); 3) case definitions to conclude to a positive status using imperfect milk- or blood-ELISA tests. The top-ranking diagnostic strategy was the same in the two contexts: testing the bulk tank milk and the blood samples, all samples collected during one visit and the herd being assigned a S. Dublin positive status if one sample is ELISA-positive. The final decision favored the top-ranking option for both contexts. This MCDA approach and its application to S. Dublin infection in dairy herds allowed a consensual, rational, and transparent ranking of feasible diagnostic strategies while taking into account the diagnostic tests accuracy, socio-economic, logistic, and perception considerations of the key actors in the dairy industry. This promising tool can be applied to other infectious diseases that lack a well-established diagnostic procedure to define a herd status.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».