Role of CYP9E2 and a long non-coding RNA gene in resistance to a spinosad insecticide in the Colorado potato beetle, Leptinotarsa decemlineata
Notice bibliographique
Résumé
Spinosads are insecticides used to control insect pests, especially in organic farming where limited tools for pest management exist. However, resistance has developed to spinosads in economically important pests, including Colorado potato beetle (CPB), Leptinotarsa decemlineata. In this study, we used bioassays to determine spinosad sensitivity of two field populations of CPB, one from an organic farm exposed exclusively to spinosad and one from a conventional farm exposed to a variety of insecticides, and a reference insecticide naïve population. We found the field populations exhibited significant levels of resistance compared with the sensitive population. Then, we compared transcriptome profiles between the two field populations to identify genes associated primarily with spinosad resistance and found a cytochrome P450, CYP9E2, and a long non-coding RNA gene, lncRNA-2, were upregulated in the exclusively spinosad-exposed population. Knock-down of these two genes simultaneously in beetles of the spinosad-exposed population using RNA interference (RNAi) resulted in a significant increase in mortality when gene knock-down was followed by spinosad exposure, whereas single knock-downs of each gene produced smaller effects. In addition, knock-down of the lncRNA-2 gene individually resulted in significant reduction in CYP9E2 transcripts. Finally, in silico analysis using an RNA-RNA interaction tool revealed that CYP9E2 mRNA contains multiple binding sites for the lncRNA-2 transcript. Our results imply that CYP9E2 and lncRNA-2 jointly contribute to spinosad resistance in CPB, and lncRNA-2 is involved in regulation of CYP9E2 expression. These results provide evidence that metabolic resistance, driven by overexpression of CYP and lncRNA genes, contributes to spinosad resistance in CPB.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».