Identification of heparin interaction sites on thrombin-activatable fibrinolysis inhibitor that modulate plasmin-mediated activation, thermal stability, and antifibrinolytic potential
Notice bibliographique
Résumé
Background: Thrombin-activatable fibrinolysis inhibitor (TAFI) is a plasma zymogen that provides a molecular link between coagulation and fibrinolysis. Studies have shown that the presence of glycosaminoglycans accelerates TAFI activation by plasmin and stabilizes activated TAFI (TAFIa). Objectives: We aimed to define the elements of TAFI structure that allow these effects. Methods: Based on crystallographic studies and homology to heparin-binding proteins, we performed mutagenesis of surface-exposed charged residues on TAFI that putatively constitute heparin-binding sites. We determined heparin binding, kinetics of activation by plasmin in the presence or absence of heparin, thermal stability, and antifibrinolytic potential of each variant. Results: Mutagenesis of Lys211 and Lys212 did not impair heparin binding but affected the ability of TAFI to be activated by plasmin. Mutagenesis of Lys306 and His308 did not impair heparin binding, but mutation of His308 had a severe negative effect on TAFI/TAFIa function. Mutation of Arg320 and Lys324 in combination markedly decreased heparin binding but had no effect on heparin-mediated acceleration of TAFI activation by plasmin while somewhat decreasing TAFIa stabilization by heparin. Mutagenesis of Lys327 and Arg330 decreased (but did not eliminate) heparin binding while decreasing the ability of heparin to accelerate plasmin-mediated TAFI activation, stabilize TAFIa, and increase the antifibrinolytic ability of TAFIa. A quadruple mutant of Arg320, Lys324, Lys327, and Arg330 completely lost heparin-binding ability and stabilization of the enzyme by heparin. Conclusion: Basic residues in the dynamic flap of TAFIa define a functionally relevant heparin-binding site, but additional heparin-binding sites may be present on TAFI.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».