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Enregistrement W4399041300 · doi:10.1093/ehjopen/oeae043

Genetic assessment of efficacy and safety profiles of coagulation cascade proteins identifies Factors II and XI as actionable anticoagulant targets

2024· article· en· W4399041300 sur OpenAlexafffundabout
Éloi Gagnon, Arnaud Girard, Jérôme Bourgault, Erik Abner, Dipender Gill, Sébastien Thériault, Marie‐Claude Vohl, André Tchernof, Tõnu Esko, Patrick Mathieu, Benoît J. Arsenault

Notice bibliographique

RevueEuropean Heart Journal Open · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBlood Coagulation and Thrombosis Mechanisms
Établissements canadiensUniversité LavalInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de Québec
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de Québec, Université LavalCanadian Institutes of Health ResearchUniversité Laval
Mots-clésCoagulation cascadeCoagulationAnticoagulantMedicineComputational biologyPharmacologyBioinformaticsInternal medicineBiologyThrombinPlatelet

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Aims Anticoagulants are routinely used by millions of patients worldwide to prevent blood clots. Yet, problems with anticoagulant therapy remain, including a persistent and cumulative bleeding risk in patients undergoing prolonged anticoagulation. New safer anticoagulant targets are needed. Methods and results To prioritize anticoagulant targets with the strongest efficacy [venous thromboembolism (VTE) prevention] and safety (low bleeding risk) profiles, we performed two-sample Mendelian randomization and genetic colocalization. We leveraged three large-scale plasma protein data sets (deCODE as discovery data set and Fenland and Atherosclerosis Risk in Communities as replication data sets] and one liver gene expression data set (Institut Universitaire de Cardiologie et de Pneumologie de Québec bariatric biobank) to evaluate evidence for a causal effect of 26 coagulation cascade proteins on VTE from a new genome-wide association meta-analysis of 44 232 VTE cases and 847 152 controls, stroke subtypes, bleeding outcomes, and parental lifespan as an overall measure of efficacy/safety ratio. A 1 SD genetically predicted reduction in F2 blood levels was associated with lower risk of VTE [odds ratio (OR) = 0.44, 95% confidence interval (CI) = 0.38–0.51, P = 2.6e−28] and cardioembolic stroke risk (OR = 0.55, 95% CI = 0.39–0.76, P = 4.2e−04) but not with bleeding (OR = 1.13, 95% CI = 0.93–1.36, P = 2.2e−01). Genetically predicted F11 reduction was associated with lower risk of VTE (OR = 0.61, 95% CI = 0.58–0.64, P = 4.1e−85) and cardioembolic stroke (OR = 0.77, 95% CI = 0.69–0.86, P = 4.1e−06) but not with bleeding (OR = 1.01, 95% CI = 0.95–1.08, P = 7.5e−01). These Mendelian randomization associations were concordant across the three blood protein data sets and the hepatic gene expression data set as well as colocalization analyses. Conclusion These results provide strong genetic evidence that F2 and F11 may represent safe and efficacious therapeutic targets to prevent VTE and cardioembolic strokes without substantially increasing bleeding risk.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,897
Score d'incertitude au seuil0,420

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,055
Tête enseignante GPT0,357
Écart entre enseignants0,302 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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