Repression of pervasive antisense transcription is the primary role of fission yeast RNA polymerase II CTD serine 2 phosphorylation
Notice bibliographique
Résumé
The RNA polymerase II carboxy-terminal domain (CTD) consists of conserved heptapeptide repeats that can be phosphorylated to influence distinct stages of the transcription cycle, including RNA processing. Although CTD-associated proteins have been identified, phospho-dependent CTD interactions have remained elusive. Proximity-dependent biotinylation (PDB) has recently emerged as an alternative approach to identify protein-protein associations in the native cellular environment. In this study, we present a PDB-based map of the fission yeast RNAPII CTD interactome in living cells and identify phospho-dependent CTD interactions by using a mutant in which Ser2 was replaced by alanine in every repeat of the fission yeast CTD. This approach revealed that CTD Ser2 phosphorylation is critical for the association between RNAPII and the histone methyltransferase Set2 during transcription elongation, but is not required for 3' end processing and transcription termination. Accordingly, loss of CTD Ser2 phosphorylation causes a global increase in antisense transcription, correlating with elevated histone acetylation in gene bodies. Our findings reveal that the fundamental role of CTD Ser2 phosphorylation is to establish a chromatin-based repressive state that prevents cryptic intragenic transcription initiation.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».