MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4399073362 · doi:10.21203/rs.3.rs-4354176/v1

Long-Term Three-Dimensional High-Resolution Imaging of Live Unlabeled Small Intestinal Organoids Using Low-Coherence Holotomography

2024· preprint· en· W4399073362 sur OpenAlexaff
YongKeun Park, Mahn Jae Lee, Jaehyeok Lee, Jeongmin Ha, Geon Kim, Hye‐Jin Kim, Sumin Lee, Bon‐Kyoung Koo

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Cells and Metastasis
Établissements canadiensKootenay Association for Science & Technology
Organismes subventionnairesInstitute for Information and Communications Technology PromotionMinistry of Science and ICT, South KoreaKorea Advanced Institute of Science and TechnologyNational Research Foundation of KoreaNational Research Foundation
Mots-clésOrganoidHigh resolutionOptical coherence tomographyCoherence (philosophical gambling strategy)Term (time)SuperresolutionComputer scienceComputer visionOpticsBiologyPhysicsRemote sensingCell biologyImage (mathematics)Geology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Organoids, which are miniature, in vitro versions of organs, present significant potential for studying human diseases and elucidating underlying mechanisms. To fully appreciate and understand the complex structure and dynamic biological phenomena of organoids, live imaging techniques play a crucial role in the field of organoid research. However, challenges in live, unlabeled high-resolution imaging of native organoids are prevalent, primarily due to the complexities of sample handling and optical scattering inherent in three-dimensional (3D) structures. Additionally, conventional imaging methods fall short in capturing the real-time dynamic processes of growing organoids. In this study, we introduce low-coherence holotomography as an advanced, label-free, quantitative imaging modality, designed to overcome related technical obstacles for long-term live imaging of 3D organoids. We demonstrate its efficacy by capturing high-resolution morphological details and dynamic activities within mouse small intestinal organoids at subcellular resolution. Moreover, our approach facilitates the distinction between viable and non-viable organoids, significantly enhancing its utility in organoid-based research. This advancement underscores the critical role of live imaging in organoid studies, offering a more comprehensive understanding of these complex systems.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,072
Tête enseignante GPT0,375
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueResearch SquareMême sujetCancer Cells and MetastasisTravaux en français237 207