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Enregistrement W4399074983 · doi:10.3390/ijms25115898

Arabidopsis Transcriptomics Reveals the Role of Lipoxygenase2 (AtLOX2) in Wound-Induced Responses

2024· article· en· W4399074983 sur OpenAlexafffund
Diljot Kaur, Andreas Schedl, Christine Lafleur, Julian Martinez Henao, Nicole M. van Dam, Jean Rivoal, Jacqueline C. Bede

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Molecular Sciences · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueInsect-Plant Interactions and Control
Établissements canadiensUniversité de MontréalMcGill University
Organismes subventionnairesFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCentre SèveDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésJasmonateMethyl jasmonateBiologyMutantPlant defense against herbivoryArabidopsisArabidopsis thalianaJasmonic acidSalicylic acidGeneWild typeTranscriptomeCell biologyGene expressionBotanyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In wounded Arabidopsis thaliana leaves, four 13S-lipoxygenases (AtLOX2, AtLOX3, AtLOX4, AtLOX6) act in a hierarchical manner to contribute to the jasmonate burst. This leads to defense responses with LOX2 playing an important role in plant resistance against caterpillar herb-ivory. In this study, we sought to characterize the impact of AtLOX2 on wound-induced phytohormonal and transcriptional responses to foliar mechanical damage using wildtype (WT) and lox2 mutant plants. Compared with WT, the lox2 mutant had higher constitutive levels of the phytohormone salicylic acid (SA) and enhanced expression of SA-responsive genes. This suggests that AtLOX2 may be involved in the biosynthesis of jasmonates that are involved in the antagonism of SA biosynthesis. As expected, the jasmonate burst in response to wounding was dampened in lox2 plants. Generally, 1 h after wounding, genes linked to jasmonate biosynthesis, jasmonate signaling attenuation and abscisic acid-responsive genes, which are primarily involved in wound sealing and healing, were differentially regulated between WT and lox2 mutants. Twelve h after wounding, WT plants showed stronger expression of genes associated with plant protection against insect herbivory. This study highlights the dynamic nature of jasmonate-responsive gene expression and the contribution of AtLOX2 to this pathway and plant resistance against insects.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,152
Score d'incertitude au seuil0,174

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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