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Enregistrement W4399090339 · doi:10.1161/circgen.123.004320

Meta-Analysis of Genome-Wide Association Studies Reveals Genetic Mechanisms of Supraventricular Arrhythmias

2024· review· en· W4399090339 sur OpenAlexafffund
Lu‐Chen Weng, Shaan Khurshid, Amelia Weber Hall, Victor Nauffal, Valerie N. Morrill, Yan V. Sun, Joel Rämö, Dominik Beer, Simon Lee, Girish N. Nadkarni, Renée Johnson, Laura Andreasen, Anne Clayton, Clive R. Pullinger, Zachary T. Yoneda, Daniel J. Friedman, Matthew C. Hyman, Renae Judy, Allan C. Skanes, Kate M. Orland, Paloma Jordà, Timothy Treu, Matthew T. Oetjens, Rajesh Subbiah, Jacob Peter Hartmann, Heidi T. May, John P. Kane, Tariq Z. Issa, Navid A. Nafissi, Peter Leong‐Sit, Marie‐Pierre Dubé, Carolina Roselli, Seung Hoan Choi, Jean‐Claude Tardif, Habib Khan, Stacey Knight, Jesper Hastrup Svendsen, Bruce D. Walker, Richard Karlsson Linnér, J. Michael Gaziano, Rafik Tadros, Diane Fatkin, Daniel J. Rader, Svati H. Shah, Dan M. Roden, Gregory M. Marcus, Ruth J. F. Loos, Scott M. Damrauer, Christopher M. Haggerty, Kelly Cho, Aarno Palotie, Morten S. Olesen, Lee L. Eckhardt, Jason D. Roberts, Michael J. Cutler, M. Benjamin Shoemaker, Peter W.F. Wilson, Patrick T. Ellinor, Steven A. Lubitz

Notice bibliographique

RevueCirculation Genomic and Precision Medicine · 2024
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac electrophysiology and arrhythmias
Établissements canadiensMontreal Heart InstituteWestern University
Organismes subventionnairesNational Health and Medical Research CouncilNovo Nordisk FondenSigrid Juséliuksen SäätiöNational Institutes of HealthCanada Research ChairsFondation LeducqInvitaeMyoKardiaMedical Research CouncilBayerEuropean CommissionBroad InstituteNational Heart, Lung, and Blood InstitutePfizerAmerican Heart AssociationBristol-Myers SquibbU.S. Department of Veterans Affairs
Mots-clésSupraventricular arrhythmiaGenome-wide association studyGenetic associationAssociation (psychology)GeneticsBiologyComputational biologyMedicineInternal medicineSingle-nucleotide polymorphismGeneGenotypeAtrial fibrillationPsychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Substantial data support a heritable basis for supraventricular tachycardias, but the genetic determinants and molecular mechanisms of these arrhythmias are poorly understood. We sought to identify genetic loci associated with atrioventricular nodal reentrant tachycardia (AVNRT) and atrioventricular accessory pathways or atrioventricular reciprocating tachycardia (AVAPs/AVRT). METHODS: We performed multiancestry meta-analyses of genome-wide association studies to identify genetic loci for AVNRT (4 studies) and AVAP/AVRT (7 studies). We assessed evidence supporting the potential causal effects of candidate genes by analyzing relations between associated variants and cardiac gene expression, performing transcriptome-wide analyses, and examining prior genome-wide association studies. RESULTS: Analyses comprised 2384 AVNRT cases and 106 489 referents, and 2811 AVAP/AVRT cases and 1,483 093 referents. We identified 2 significant loci for AVNRT, which implicate NKX2-5 and TTN as disease susceptibility genes. A transcriptome-wide association analysis supported an association between reduced predicted cardiac expression of NKX2-5 and AVNRT. We identified 3 significant loci for AVAP/AVRT, which implicate SCN5A , SCN10A , and TTN/CCDC141 . Variant associations at several loci have been previously reported for cardiac phenotypes, including atrial fibrillation, stroke, Brugada syndrome, and electrocardiographic intervals. CONCLUSIONS: Our findings highlight gene regions associated with ion channel function (AVAP/AVRT), as well as cardiac development and the sarcomere (AVAP/AVRT and AVNRT) as important potential effectors of supraventricular tachycardia susceptibility.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: Méta-analyse
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,091
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0080,003
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,093
Tête enseignante GPT0,354
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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